商标申请被驳回后，所交纳的费用通常是不予退还的，但具体情况需根据费用类型和合同约定来分析。以下是对这一问题的详细解答：
商标局收取的官费不予退还：
- 商标局在受理商标申请后，会投入相应的人力和资源进行审查，包括形式审查和实质审查等环节。无论商标注册最终是否成功，这些成本都是无法回收的。因此，根据我国《商标法》的相关规定，商标注册申请被驳回时，交纳的官费（如目前国内商标注册的官费为300元/类别，每超过1个另加收30元）是不会退回的。
- 举例来说，如果您申请了一个商标并缴纳了300元的官费，但商标局审查后认为该商标不符合注册条件而予以驳回，那么这300元官费是不会退还给您的。
委托商标代理机构的代理费视合同约定：
- 如果您是通过商标代理机构来办理商标注册的，那么代理费用的退还情况就需要根据您与代理机构签订的服务合同来确定。
- 部分代理机构为了吸引客户，可能会在合同中承诺若商标注册被驳回，将退还全部或部分代理费。在这种情况下，只要符合退款条件，代理机构就应按约定退还相应费用。
- 然而，如果合同中没有关于商标被驳回后代理费退还的约定，且代理机构已按照合同履行了提交申请等相关服务义务，那么代理机构通常不会退还代理费。
面对商标注册被驳回的情况，您可以采取以下措施：
- 了解驳回原因：首先，您应仔细阅读商标局发出的驳回通知书，明确具体的驳回原因，如违反商标法的禁止性规定、与在先权利冲突、商标缺乏显著性等。
- 提出复审申请：如对驳回理由有异议，您可在收到驳回通知书之日起十五天内向商标评审委员会提出复审申请。复审时需提供充分的证据和理由，以证明商标的合法性和可注册性。
- 考虑修改商标：若商标被驳回是因缺乏显著性或与现有商标近似，您可对商标进行修改，调整其文字、图形、颜色等元素，增强显著性和区分度，并重新提交注册申请。
- 调整商品或服务范围：如商标被驳回是因商品或服务范围不明确或过于宽泛，您可考虑放弃部分商品或服务，缩小范围以提高注册成功率。
- 重新申请：若上述方式均无法解决问题，您可考虑重新申请。由于商标审查涉及审查员的主观判断，重新申请可能遇到不同的审查结果。
- 提起诉讼：如复审请求未获支持，您仍可在规定时间内向法院提起诉讼，通过司法途径维护自身权益。
建议与注意事项：
- 在委托商标代理机构时，务必仔细阅读服务合同条款，特别是关于费用处理和后续服务的约定，以避免不必要的纠纷。
- 商标注册被驳回后，应及时采取措施，并密切关注商标局的通知和裁定，确保操作的合法性和有效性。
- 如需更专业的指导和支持，您可以随时向我咨询，我将根据您的具体情况提供针对性的法律建议。