结论：公司事后追认对账单，在符合一定条件下，诉讼时效会中断。以下从多个角度进行详细分析：
诉讼时效中断的法律规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百九十五条：“有下列情形之一的，诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算：（一）权利人向义务人提出履行请求；（二）义务人同意履行义务；（三）权利人提起诉讼或者申请仲裁；（四）与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形”。公司事后追认对账单，可以视为义务人（公司）同意履行义务的一种表现，因此，在符合该条款规定的情况下，诉讼时效会中断。
事后追认的具体情形与诉讼时效中断
明确追认：如果公司以书面形式或其他明确方式表示追认对账单，且该追认行为能够到达或应当到达相对方（如员工或相关债权人），则诉讼时效会中断。这是因为公司的追认行为构成了对原债务的重新确认，表明公司愿意承担对账单上的债务，从而打破了诉讼时效的连续性。
追认的时间点：诉讼时效的中断需要发生在诉讼时效期间内。如果公司在对账单已经超过诉讼时效期间后进行追认，那么这种追认行为通常不会导致诉讼时效的中断，因为此时诉讼时效已经届满，权利已经丧失。但是，如果公司在诉讼时效期间内进行了追认，即使对账单原本已经超过了某个特定的时间点（如员工签字后的某个时间），诉讼时效也会从追认之日起重新计算。
追认的效力：公司的追认行为应当具有法律效力，即公司应当具有追认的资格和权限。如果公司是无权追认或者追认行为存在其他无效情形（如欺诈、胁迫等），则该追认行为不会导致诉讼时效的中断。
实际操作中的建议
保留证据：如果公司希望通过对账单的追认来中断诉讼时效，应当确保追认行为有充分的证据支持，如书面追认函、电子邮件、短信等。这些证据应当能够证明公司确实进行了追认，并且该追认行为已经到达或应当到达相对方。
及时追认：公司应当在对账单诉讼时效期间内及时进行追认，以避免诉讼时效届满后无法再通过追认来中断诉讼时效。
咨询专业律师：在实际操作中，公司可能会遇到各种复杂情况，如追认行为的效力、诉讼时效的计算等。因此，建议公司在进行追认前咨询专业律师，以确保追认行为的合法性和有效性。
总结与启示：公司事后追认对账单在符合一定条件下可以导致诉讼时效的中断。为了确保追认行为的合法性和有效性，公司应当保留充分的证据、及时进行追认，并在必要时咨询专业律师。如果您在处理类似问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。