针对河道中违章建筑的处理问题，这是一个涉及法律法规和行政程序的复杂过程。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律法规依据
河道中的违章建筑明确违反了《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国防洪法》及《河道管理条例》等多部法律法规。这些法规明确禁止在河道管理范围内建设妨碍行洪的建筑物、构筑物，以及从事其他影响河势稳定、危害河岸堤防安全的活动。
二、处理流程
立案调查与认定：
- 相关执法部门（如水利部门、自然资源部门或乡、镇人民政府等）在接到举报或日常巡查中发现疑似违建后，会立即组织人员进行现场勘查和调查询问。
- 执法部门会详细记录违建的位置、面积、结构等信息，并收集相关证据材料。
- 依据相关法律法规，对涉嫌违建的建筑进行性质认定，并出具书面认定书送达当事人。
责令整改与通知：
- 执法部门会向违建当事人下达责令停止违法行为通知书，要求其补办审查同意或者审查批准手续；若工程设施建设严重影响防洪，则责令限期拆除。
- 当事人在收到通知书后有权进行陈述和申辩，执法部门会认真听取并记录，必要时进行复核。
行政处罚决定：
- 若当事人未在规定期限内自行拆除违建，执法部门会依法作出行政处罚决定，明确拆除要求、期限以及逾期不拆除的法律后果。
- 此决定会依法送达当事人，确保其知晓并理解处罚内容。
强制拆除：
- 在行政处罚决定规定的期限届满后，若当事人仍未拆除违建，执法部门会作出强制拆除决定，并公告拆除时间、地点等信息。
- 执法部门会制定详细的拆除方案，包括人员安排、安全保障措施等，并在实施拆除时邀请公证机关进行现场公证，确保拆除过程的合法性和安全性。
三、法律责任
- 根据《中华人民共和国水法》第六十五条，对于在河道管理范围内建设妨碍行洪的建筑物、构筑物的行为，执法部门会责令停止违法行为，限期拆除违法建筑，恢复原状；逾期不改者，将强行拆除并由违法者承担费用，并处以一万元以上十万元以下的罚款。
- 根据《中华人民共和国防洪法》第五十七条，对于未经水行政主管部门审查同意或未按照审查批准的位置、界限在河道、湖泊管理范围内从事工程设施建设活动的行为，执法部门会责令停止违法行为，补办审查同意或者审查批准手续；工程设施建设严重影响防洪的，责令限期拆除，逾期不拆除的，强行拆除，所需费用由建设单位承担；影响行洪但尚可采取补救措施的，责令限期采取补救措施，可以处一万元以上十万元以下的罚款。
四、建议与注意事项
- 了解法律法规：相关当事人应首先了解并遵守相关法律法规，避免违法行为带来的法律后果。
- 及时咨询法律意见：若已存在违建行为，应尽快咨询专业的法律顾问或律师，了解具体的法律意见和帮助，以便及时采取措施纠正错误，减少损失。
- 配合执法部门工作：在违建处理过程中，当事人应积极配合执法部门的工作，按照要求进行整改或拆除。
- 加强后续监管：政府部门应加强河道的后续监管工作，确保河道恢复原状并防止新的违章建筑出现。
综上所述，河道中的违章建筑处理是一个涉及多个法定程序和法律依据的严谨过程。执法部门会严格按照法定程序和法律依据进行操作，确保行政行为的合法性和合理性。同时，相关当事人也应积极配合执法部门的工作，共同维护河道的生态环境安全。