结论：天窗未关闭导致雨水进入车辆，保险公司是否赔偿需分情况讨论，主要取决于是否购买了对应险种以及事故的具体性质。
如果购买了车损险，且事故属于保险责任范围
根据《机动车综合商业保险示范条款》第六条，车损险的保险责任包括“暴雨、洪水等自然灾害造成的车辆损失”。但需注意：
- 关键区分点：若雨水进入是由于“暴雨”等自然灾害导致（如气象部门证明降雨量达到暴雨标准），即使天窗未关闭，保险公司通常需赔偿；
- 例外情形：若仅为普通降雨，且因车主未关闭天窗（属于主动疏忽），保险公司可能以“未尽到妥善保管车辆义务”为由拒赔，除非能证明车辆存在设计缺陷（如天窗自动关闭功能失效）。
如果未购买车损险，或事故属于免责范围
- 未购车损险：车辆因雨水导致的损失不属于交强险赔偿范围（交强险仅赔第三方损失），车主需自行承担维修费用；
- 免责情形：若保险条款明确将“车主故意或重大过失导致损失”（如明知天窗未关仍停放于露天）列为免责事由，保险公司可能拒赔。
建议行动步骤：
- 立即报案：联系保险公司说明情况，保留现场照片、视频等证据；
- 核实条款：查看保险合同中“保险责任”和“责任免除”条款，确认是否覆盖该情形；
- 协商或投诉：若保险公司拒赔，可要求其出具书面拒赔通知，并依据《保险法》第23条主张权利（保险公司需在30日内核定损失）；
- 诉讼准备：若协商无果，可向法院起诉，需提供气象证明、维修清单等证据。
风险提示：
- 频繁因疏忽导致类似事故，可能影响次年保费折扣或被保险公司拒保；
- 若车辆改装过天窗（如扩大尺寸），可能因“改变车辆结构”导致保险失效。
如有进一步细节（如保险条款具体内容、事故发生时的天气状况等），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。