公司因使用盗版软件被厂家起诉，首先应当明确的是，公司确实存在侵权行为，需要积极应对诉讼，并考虑后续的合规整改措施。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：
一、法律背景与侵权责任
软件著作权保护：
- 根据《中华人民共和国著作权法》及相关规定，软件作为著作权法保护的作品之一，其著作权人享有复制权、发行权、出租权、信息网络传播权等多项权利。未经著作权人许可，擅自复制、发行、出租或通过信息网络向公众传播其软件作品，均构成侵权。
侵权责任：
- 公司使用盗版软件，侵犯了软件著作权人的复制权等权利，依法应承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。若侵权行为情节严重，还可能构成犯罪，依法应追究刑事责任。
二、应对诉讼的策略
积极应诉：
- 公司收到起诉状后，应及时组织法律团队或委托专业律师进行应诉准备。包括收集证据、分析案情、制定应诉策略等。
- 在应诉过程中，公司应如实陈述事实，提供相关证据，如软件购买记录、使用情况说明等，以证明自身并非故意侵权或已采取合理措施防止侵权。
寻求和解：
- 在诉讼过程中，公司可以与软件著作权人进行协商，寻求和解的可能性。和解可以包括停止使用盗版软件、支付合理的赔偿费用、签订正版软件使用协议等。
- 和解有助于减少诉讼成本和时间，同时也有助于维护公司的商业信誉和形象。
准备抗辩理由：
- 如果公司认为自身并未构成侵权或存在其他抗辩事由（如合理使用、善意侵权等），应在应诉过程中充分阐述并提供相关证据支持。
- 需要注意的是，抗辩理由的成立需要严格符合法律规定的条件，因此公司应谨慎评估自身情况并咨询专业律师的意见。
三、后续合规整改措施
停止使用盗版软件：
- 公司应立即停止使用所有盗版软件，并卸载或销毁相关软件及其复制件。
采购正版软件：
- 公司应根据实际需求采购正版软件，并确保所有员工均使用正版软件进行工作。
- 在采购正版软件时，公司应与软件供应商签订正式的采购合同，并保留好相关凭证和记录。
加强内部管理：
- 公司应建立健全的软件使用管理制度，明确软件采购、安装、使用、维护等各个环节的责任和流程。
- 定期对员工进行软件知识产权保护方面的培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识。
建立合规审查机制：
- 公司可以设立专门的合规审查部门或委托第三方机构对公司的软件使用情况进行定期审查和监督，确保公司始终符合相关法律法规的要求。
四、可能的法律后果
民事赔偿：
- 如果公司被认定构成侵权，可能需要向软件著作权人支付赔偿费用。赔偿费用的数额将根据侵权行为的性质、情节、后果等因素综合确定。
行政处罚：
- 除了民事赔偿外，公司还可能面临行政处罚的风险。如市场监管部门可以责令停止侵权行为、没收违法所得、罚款等。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果公司的侵权行为情节严重构成犯罪（如侵犯著作权罪），相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。
综上所述，公司因使用盗版软件被厂家起诉后，应积极应对诉讼并考虑后续的合规整改措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。