交通事故后在民营医院就医的医疗档案，在符合一定条件下是可以作为伤残鉴定材料的。具体分析如下：

1. 医疗档案的合法性：首先，无论公立还是民营医院，只要其具备合法的医疗执业资质，其出具的医疗档案在法律上均具有合法性。这意味着，只要民营医院是依法设立并运营的，其记录的患者诊疗过程、伤情诊断、治疗方案及康复情况等信息，均可作为伤残鉴定的基础材料。

2. 医疗档案的完整性与真实性：伤残鉴定机构在评估伤残等级时，会重点审查医疗档案的完整性和真实性。这包括病历记录、检查报告、手术记录、护理记录、用药记录等所有与伤情治疗相关的文件。因此，确保民营医院的医疗档案完整、准确、无篡改，是将其作为伤残鉴定材料的关键。

3. 鉴定机构的要求：不同的伤残鉴定机构可能对医疗档案的具体要求有所不同。有些机构可能更倾向于接受公立医院出具的医疗档案，但这并不意味着民营医院的档案不被接受。关键在于档案的内容是否能够满足鉴定机构对伤情评估的需要。因此，在提交民营医院的医疗档案前，最好先与鉴定机构沟通，了解其对档案的具体要求。

4. 法律程序与证据规则：在法律程序中，证据的采纳需遵循一定的规则。只要民营医院的医疗档案符合证据的真实性、合法性和关联性要求，且能够与其他证据相互印证，形成完整的证据链，就有可能被法院或仲裁机构采纳为伤残鉴定的依据。

建议：

• 在选择民营医院就医时，尽量选择信誉良好、医疗水平较高的医院，以确保医疗档案的质量。
• 在治疗过程中，妥善保管好所有医疗文件，包括病历、检查报告、发票等，以备伤残鉴定时使用。
• 在提交伤残鉴定申请前，先与鉴定机构沟通，了解其对医疗档案的具体要求，以便有针对性地准备材料。
• 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保伤残鉴定过程的顺利进行和鉴定结果的公正性。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您在交通事故伤残鉴定方面还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。