在综合工时制度下，加班费的计算是一个相对复杂但又有明确规则的过程。以下是对综合工时制度下加班费如何计算的详细解答：
一、综合工时制的基本原则
综合工时制允许企业以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但要求平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间（即每日8小时，每周40小时）基本相同。这意味着，虽然工作时间可以灵活安排，但长期来看，员工的工作时间总量应受到控制，以保障其休息和健康的权利。
二、加班费的计算方法
在综合工时制下，加班费的计算主要依据实际工作时间与法定标准工作时间的对比，以及加班的具体类型（延长工作时间、休息日加班、法定节假日加班）来确定。
延长工作时间加班：
- 当员工在综合计算周期内的实际工作时间超过该周期的法定标准工作时间时，超出部分视为延长工作时间。
- 计算公式：延时加班费 = 月工资 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 加班小时数 × 150%。
- 这里，月工资通常指基本工资部分，不包括奖金、津贴等；21.75天是月平均计薪天数；8小时是标准工作日的小时数。
休息日加班（若总工作时间未超标但某日或某周超标且未安排补休）：
- 若在休息日安排工作，且该休息日的工作不能通过补休来抵消，即使总工作时间未超标，也应支付加班费。但需注意，如果综合计算周期内总工作时间未超标，且能安排补休的，应优先安排补休。
- 计算公式：休息日加班费 = 月工资 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 加班小时数 × 200%。
法定节假日加班：
- 无论综合计算周期内工作时间是否超标，法定节假日工作均需支付加班费。
- 计算公式：法定节假日加班费 = 月工资 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 加班小时数 × 300%（或按日计算：月工资 ÷ 21.75天 × 加班天数 × 300%）。
三、实例分析
假设员工小张所在企业实行以月为周期的综合工时制，月工资为5000元，该月法定标准工作时间为160小时（20天×8小时）。小张在该月实际工作了180小时，其中包含1天法定节假日（当天工作8小时）。
- 小时工资：5000 ÷ (21.75 × 8) ≈ 28.74元/小时。
- 延长工作时间加班工资：延长工作时间为180 - 160 - 8（法定节假日）= 12小时，加班费 = 12 × 28.74 × 150% = 517.32元。
- 法定节假日加班工资：8 × 28.74 × 300% = 689.76元。
- 该月总的加班工资：517.32 + 689.76 = 1207.08元。
四、注意事项
- 地区差异：各地对于综合工时制的具体规定和操作可能存在差异，企业在实施时应参照当地法律法规和政策执行。
- 补休安排：在综合计算周期内，如果某一具体日（或周）的实际工作时间超过标准，且能安排补休的，应优先安排补休，以减少加班费的支出。
- 合同约定：加班费的具体计算方式可能还受到企业规章制度及劳动合同约定的影响，因此在实际操作中应综合考虑各项因素。
- 咨询专业意见：对于复杂的加班费计算问题或特殊案例，建议企业咨询当地劳动部门或专业律师，以确保合规操作。
综上所述，综合工时制下的加班费计算需根据具体的工作时间、加班类型及法定规定进行细致核算。企业应严格遵守相关法律法规的规定，保障员工的合法权益，同时合理安排工作时间和休息休假，以提高员工的工作效率和满意度。