结论：二手房合同本身不会留案底，但因合同纠纷引发的诉讼或仲裁可能会留下相关记录。以下从不同角度为你详细分析：
一、合同本身不会留案底
“案底”一词，在法律语境下，通常指的是个人因违法犯罪行为而留下的刑事犯罪记录。二手房合同，作为民事法律行为的一种，其本质是双方当事人就房屋买卖事宜达成的合意，并受到《中华人民共和国民法典》等民事法律的调整。单纯的二手房合同签订和履行，并不涉及违法犯罪行为，因此不会留下所谓的“案底”。
二、合同纠纷可能留下相关记录
虽然二手房合同本身不会留案底，但如果因合同履行过程中发生纠纷，比如一方违约、房屋存在质量问题等，导致双方无法协商解决，进而引发诉讼或仲裁，那么这些诉讼或仲裁的记录可能会被保留在司法机关或仲裁机构的档案中。这些记录并不等同于“案底”，但它们确实反映了双方因合同纠纷而产生的法律争议。
诉讼记录：如果因二手房合同纠纷向法院提起诉讼，法院会依法进行审理，并作出判决或裁定。这些诉讼文书，包括起诉状、答辩状、证据材料、判决书或裁定书等，都会被法院存档，并可能通过公开渠道（如中国裁判文书网）进行公开。这些记录虽然不是“案底”，但会对当事人的信用状况产生一定影响。
仲裁记录：如果双方在合同中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么因合同纠纷可以向仲裁机构申请仲裁。仲裁机构会依法进行仲裁，并作出仲裁裁决。仲裁裁决书也会被仲裁机构存档，并可能对当事人的信用状况产生影响。不过，与诉讼记录相比，仲裁记录的公开程度可能较低，具体取决于仲裁机构的规则和当事人的约定。
三、法律建议
签订合同时要谨慎：在签订二手房合同时，双方应充分了解合同条款，确保合同内容合法、有效，并明确双方的权利和义务。这有助于减少合同纠纷的发生，从而避免留下不必要的法律记录。
发生纠纷时及时协商：如果因合同履行过程中发生纠纷，双方应首先尝试通过协商的方式解决。协商解决不仅成本较低，而且有助于维护双方的关系和信誉。
寻求法律帮助：如果协商无果，或者纠纷较为复杂，建议及时寻求专业的法律帮助。律师可以根据具体情况，为当事人提供法律咨询、代理诉讼或仲裁等服务，帮助当事人维护自己的合法权益。
如果你在二手房交易过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。