结论：交警指挥闯红灯是可以申诉的，且因交警指挥而闯红灯不属于违法行为。以下是详细的解释和申诉流程：
一、法律依据与情况说明
根据《中华人民共和国道路交通安全法》第四十四条的规定，机动车通过交叉路口时，应依照交通信号灯、交通标志、交通标线或交通警察的指挥通行。因此，在交警现场指挥的情况下，即使与交通信号灯指示不一致，驾驶员也应按照交警的指挥通行。这种情况下闯红灯，不属于违法行为，车主有权进行申诉。
二、申诉流程
了解违章详情：
- 首先，车主应前往当地交通支队查询违章的具体信息，包括监控录像，以确认是在交警指挥下闯红灯。
收集证据材料：
- 现场记录：尽量用手机拍摄交警指挥动作及周围环境，或记下事发路段是否有监控摄像头，以便后续调取监控录像作为证据。
- 交警证明：若可能，向指挥的交警索要书面说明或记录其警号，以便后续核实情况。
- 准备证件：车主需准备身份证、驾驶证、行驶证及处罚决定书的原件及复印件。
正式提出申诉：
- 线上申诉：车主可以登录当地交警部门官网或使用相关APP，按照指引填写并提交申诉信息及材料。
- 线下申诉：车主也可以携带准备好的材料前往作出处罚决定的交警大队违法处理窗口，填写申诉表并详细阐述情况。
申诉内容要点：
- 在申诉表中，车主应明确说明是在交警指挥下闯红灯，并附上所有收集到的证据材料，如现场照片、视频及交警证明等。
三、等待审核与处理
审核流程：
- 交警部门将对提交的材料进行审核调查，可能包括调取监控视频和与相关交警核实情况。
处理结果：
- 申诉成功：违章记录将被撤销，车主无需承担闯红灯的处罚。
- 申诉失败：车主会收到具体原因说明，此时可根据规定申请行政复议或提起行政诉讼。
四、后续行动与注意事项
复议或诉讼：
- 若对申诉结果有异议，车主可向上一级交警部门申请复核，或依据法律程序进行行政复议或行政诉讼。
注意事项：
- 确保材料真实有效：车主应确保提供的所有材料真实有效，不得伪造或篡改证据。
- 积极配合调查：车主应积极配合相关部门的调查和处理工作，如实陈述事实情况。
- 及时咨询：若对申诉流程或法规有疑问，车主应及时咨询当地交警部门或向我这样的法律专业人士咨询。
示例说明：
假设车主李先生在行驶过程中遇到交警现场指挥交通，由于交警的指挥与交通信号灯指示不一致，李先生按照交警的指挥闯了红灯。事后，李先生收到了闯红灯的处罚通知。此时，李先生可以按照上述申诉流程进行申诉，提供现场照片、视频及交警证明等证据材料，以证明自己是在交警指挥下闯红灯的。若申诉成功，李先生的违章记录将被撤销。
总结与建议：
因交警指挥而闯红灯被拍后，车主应及时了解违章详情、收集证据材料并按照法定程序提出申诉。在整个过程中，保持材料的真实性、完整性和合法性是申诉成功的关键。若您遇到类似情况或有其他法律问题，欢迎直接向我咨询。