结论：银行卡拒绝交易后去柜台办理，一般情况下不会被抓。但具体是否会被抓，取决于拒绝交易的原因以及是否涉及违法犯罪行为。
分析：
正常情况下的拒绝交易：
- 银行卡拒绝交易可能由于多种原因，如卡片损坏、密码错误次数过多、账户余额不足、银行系统故障等。这些情况下，持卡人前往银行柜台办理相关业务，如更换卡片、重置密码、存款等，是正常且合法的行为，不会被抓。
涉及违法犯罪行为的拒绝交易：
- 如果银行卡拒绝交易是因为账户涉及违法犯罪行为，如洗钱、诈骗、非法集资等，那么情况就不同了。在这种情况下，银行可能会根据相关法律法规和内部规定，对账户进行冻结或限制交易，并可能向公安机关报案。
- 如果持卡人明知账户涉及违法犯罪行为，仍然前往银行柜台办理相关业务，试图掩盖或转移资金，那么这种行为就可能构成犯罪，持卡人可能会因此被抓。
银行与公安机关的协作：
- 银行在发现账户存在异常交易或涉嫌违法犯罪行为时，有义务向公安机关报案，并提供相关线索和证据。
- 公安机关在接到报案后，会依法进行调查，并根据调查结果采取相应的法律措施。如果持卡人确实涉及违法犯罪行为，那么公安机关有权对其采取强制措施，包括抓捕。
建议：
- 如果您的银行卡拒绝交易，首先不要慌张，先尝试通过银行客服或网上银行等渠道了解拒绝交易的具体原因。
- 如果原因不明或涉及复杂情况，建议前往银行柜台咨询并办理相关业务。在办理过程中，如实说明情况，配合银行工作人员的调查和询问。
- 如果您怀疑自己的账户可能涉及违法犯罪行为，或者已经接到公安机关的调查通知，那么建议您立即咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并积极配合调查工作。
总结：银行卡拒绝交易后去柜台办理，一般情况下不会被抓。但具体是否会被抓，取决于拒绝交易的原因以及是否涉及违法犯罪行为。因此，持卡人在遇到银行卡拒绝交易的情况时，应保持冷静，了解原因，并积极配合银行和公安机关的调查工作。如有任何疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。