是的，法院可以以程序不合法为由驳回强制执行申请。以下从多个角度为你详细分析：
一、程序不合法的具体情形
执行申请不符合法定形式要件：
- 例如，申请执行书未写明申请执行的理由、事项、执行标的，以及申请执行人所了解的被执行人的财产状况等必要信息，或者未附上作为执行依据的法律文书副本等。
- 根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》等相关规定，执行申请应当符合法定形式要件，否则法院可以裁定驳回。
执行申请超出法定期限：
- 申请执行的期间为二年，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从规定的每次履行期间的最后一日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。
- 如果申请执行人未在法定期限内提出执行申请，法院将不予受理或驳回申请。
执行依据被撤销或变更：
- 如果作为执行依据的法律文书（如判决书、调解书等）因存在错误或违法情形而被依法撤销或变更，那么基于该文书进行的强制执行就失去了合法基础。
- 在这种情况下，法院应当裁定驳回执行申请，或者根据变更后的法律文书进行执行。
执行过程中存在程序违法：
- 例如，法院在执行过程中未依法向被执行人送达执行通知书、报告财产令等法律文书，或者未依法对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施。
- 如果被执行人提出异议并经法院审查确认存在程序违法情形的，法院可以裁定驳回执行申请或撤销已采取的执行措施。
二、程序不合法驳回强制执行的法律依据
- 《中华人民共和国民事诉讼法》：该法规定了执行程序的基本原则和具体规定，包括执行申请的条件、执行期限、执行依据等。如果执行申请不符合这些规定，法院可以裁定驳回。
- 《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定（试行）》：该规定对执行程序中的具体问题进行了详细规定，包括执行申请的形式要件、执行期限的计算、执行依据的审查等。如果执行申请违反这些规定，法院同样可以裁定驳回。
三、程序不合法驳回强制执行后的救济途径
- 申请复议：如果当事人对法院驳回执行申请的裁定不服，可以在法定期限内向上一级法院申请复议。复议期间不停止执行裁定的效力。
- 重新申请执行：如果驳回执行申请是因为程序上的瑕疵或错误，且这些瑕疵或错误可以通过补正或纠正来消除，那么当事人可以在补正或纠正后重新向法院申请执行。
四、实际案例说明
假设在一起合同纠纷案件中，申请执行人未在法定期限内提出执行申请，且未提供充分的证据证明被执行人存在可供执行的财产。法院在审查执行申请时发现这些问题后，可以裁定驳回执行申请。申请执行人如果对该裁定不服，可以在法定期限内向上一级法院申请复议或重新准备材料后再次申请执行。
建议：在提出强制执行申请前，务必确保申请符合法定形式要件、未超出法定期限、执行依据合法有效且未被撤销或变更。如果对执行程序有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。