结论是：重度残疾人租房居住，二人签字的协议在符合法定条件的情况下是合法的。以下从多个角度进行分析：
一、协议合法性的基本条件
民事行为能力：
- 协议双方，包括重度残疾人和另一方（可能是房东或合租者），都需要具备相应的民事行为能力。对于重度残疾人，如果其具备完全民事行为能力（如成年且精神状况正常），则有权独立签订租房协议。
- 如果重度残疾人属于限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则需要由其法定代理人（如监护人）代为签订协议，或者在其法定代理人的同意、追认下签订。
协议内容合法：
- 租房协议的内容必须符合法律法规的规定，不得包含违法或违背公序良俗的条款。例如，租金、租期、押金等条款应当合理且合法。
双方真实意思表示：
- 协议必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。重度残疾人在签订协议时，应当能够充分理解协议内容，并自愿作出意思表示。
二、特殊情况下的考虑
重度残疾人的特殊需求：
- 在签订租房协议时，应当充分考虑重度残疾人的特殊需求，如无障碍设施、居住环境等。如果房东或合租者能够满足这些需求，并在协议中明确约定，则有助于保障重度残疾人的合法权益。
法律援助与保护：
- 如果重度残疾人在签订租房协议过程中遇到困难或需要法律帮助，可以寻求法律援助机构的支持。法律援助机构可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助重度残疾人维护自己的合法权益。
三、协议签订后的法律效力
协议生效：
- 一旦租房协议满足上述条件并签订完成，即具有法律效力。双方应当按照协议约定履行各自的义务，如支付租金、提供居住条件等。
违约责任：
- 如果一方违反协议约定，应当承担相应的违约责任。例如，如果房东未按照协议提供居住条件或擅自提高租金，重度残疾人可以要求房东承担违约责任或解除协议。
四、建议与注意事项
明确协议条款：
- 在签订租房协议时，建议双方明确约定各项条款，如租金、租期、押金、维修责任等。这有助于避免后续纠纷的发生。
保留证据：
- 双方在签订和履行协议过程中，应当保留相关证据，如协议文本、支付凭证、沟通记录等。这些证据在发生纠纷时将起到重要作用。
及时咨询法律专业人士：
- 如果在签订或履行租房协议过程中遇到任何疑问或问题，建议及时咨询法律专业人士（如我），以确保自己的合法权益得到保障。
如果您在租房协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。