结论前置：借条约定三年内还清，在未满三年的情况下，债权人当然可以起诉债务人，且此时一般不会因诉讼时效问题面临败诉风险。以下是对此问题的详细解析：
一、借条中三年还款期限的性质
借条中约定的三年还款期限，是债务履行期限，而非限制起诉的时间。这意味着，在三年期限内，债权人有权要求债务人按照约定履行还款义务。如果债务人未按时履行，债权人可以通过法律途径来维护自己的权益，包括向法院提起诉讼。
二、未满三年起诉的法律依据
《民法典》关于诉讼时效的规定：
- 根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 在借条纠纷中，如果约定了明确的还款期限，那么诉讼时效从该还款期限届满之日起开始计算三年。因此，在未满三年的情况下，诉讼时效尚未开始计算或未届满，债权人起诉不会因诉讼时效问题而败诉。
起诉条件：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十二条，起诉必须满足以下条件：原告是与案件有直接利害关系的公民、法人或其他组织；有明确的被告；提出具体的诉讼请求和事实、理由；属于人民法院受理民事诉讼的范围，并受受诉人民法院管辖。
- 在借条纠纷中，只要债权人符合上述起诉条件，且借条真实有效，就可以向法院提起诉讼要求债务人还款。
三、未满三年起诉的特殊情况
虽然一般情况下未满三年起诉不会面临诉讼时效问题，但也存在一些特殊情况需要注意：
债务人明确表示或行为表明不履行义务：
- 如果债务人在三年期限内通过书面、口头等方式明确表示到期将不会履行还款义务，或者通过转移财产、挥霍财产、逃避债务等行为表明其不会履行债务，且明显丧失履行债务能力，债权人可以依据不安抗辩权等相关法律规定提前起诉。
借条中存在其他违约条款：
- 如果借条中除了还款期限外，还约定了其他违约条款（如违约金、利息等），且债务人在三年期限内违反了这些条款，债权人也可以根据合同约定和法律规定提前起诉。
四、实际操作建议
保留证据：
- 无论是否在债务履行期限内起诉，债权人都应妥善保留借条、转账记录、聊天记录等相关证据，以便在诉讼中证明自己的权益。
及时起诉：
- 如果债务人未按时履行还款义务，且债权人希望尽快追回借款，可以在未满三年的情况下及时向法院提起诉讼。这样可以避免债务人转移财产或逃避债务等风险。
关注诉讼时效：
- 虽然未满三年起诉一般不会面临诉讼时效问题，但债权人仍应关注诉讼时效的规定。如果超过诉讼时效期间再起诉，可能会因被告提出抗辩而丧失胜诉权。
总结：借条约定三年内还清，在未满三年的情况下，债权人当然可以起诉债务人。此时一般不会因诉讼时效问题面临败诉风险。但为了确保自身权益得到有效保护，债权人应保留好相关证据，并在必要时及时向法院提起诉讼。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。