自媒体公司侵入用户手机植入病毒的行为是违法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

1. 从刑法角度：

   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法侵入计算机信息系统或者采用其他技术手段，获取该计算机信息系统中存储、处理或者传输的数据，或者对该计算机信息系统实施非法控制，情节严重的，构成非法侵入计算机信息系统罪或非法控制计算机信息系统罪。自媒体公司侵入用户手机植入病毒，显然属于非法侵入并可能非法控制用户手机系统的行为，如果情节严重，将面临刑事处罚。
   • 此外，如果植入病毒导致用户手机数据泄露、财产损失等严重后果，自媒体公司还可能构成破坏计算机信息系统罪或盗窃罪等，依法应承担更重的刑事责任。

2. 从民法角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，自然人的个人信息受法律保护。任何组织或者个人不得非法收集、使用、加工、传输他人个人信息，不得非法买卖、提供或者公开他人个人信息。自媒体公司侵入用户手机植入病毒，很可能获取用户的个人信息，如通讯录、短信、照片等，这侵犯了用户的隐私权和个人信息保护权。
   • 用户有权要求自媒体公司停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔礼道歉，并可以要求赔偿损失。如果自媒体公司的行为给用户造成了严重的精神损害，用户还可以要求精神损害赔偿。

3. 从行政法角度：

   • 根据《中华人民共和国网络安全法》的相关规定，任何个人和组织不得从事非法侵入他人网络、干扰他人网络正常功能、窃取网络数据等危害网络安全的活动。自媒体公司侵入用户手机植入病毒，显然违反了这一规定。
   • 网络安全管理部门有权对自媒体公司进行行政处罚，包括警告、罚款、没收违法所得、责令暂停相关业务、停业整顿、关闭网站、吊销相关业务许可证或者吊销营业执照等。

法律建议：

• 如果用户发现自媒体公司侵入了自己的手机并植入了病毒，应立即采取措施保护自己的手机安全，如更改密码、卸载可疑应用、进行病毒查杀等。
• 同时，用户应保留相关证据，如截图、日志文件等，以便后续维权。
• 用户可以向公安机关报案，要求追究自媒体公司的刑事责任；也可以向法院提起民事诉讼，要求自媒体公司承担民事责任；还可以向网络安全管理部门投诉，要求对自媒体公司进行行政处罚。

可能后果：

• 自媒体公司如果被认定违法，将面临刑事处罚、民事赔偿和行政处罚等多重法律后果。
• 对于用户而言，如果能够及时维权，有可能获得相应的赔偿和道歉；但如果未能及时采取措施或保留证据不足，则可能面临维权困难的情况。

综上所述，自媒体公司侵入用户手机植入病毒的行为是违法的，用户应积极采取措施保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。