若挂靠的工程公司破产，您需要分情况采取以下措施来维护自身权益：

1. 确认挂靠协议的效力及内容
   首先，需审查您与工程公司签订的挂靠协议是否合法有效。根据《建筑法》及相关司法解释，若挂靠行为违反法律强制性规定（如无资质挂靠），协议可能被认定为无效。但即使协议无效，您仍可依据《民法典》关于合同无效后的处理原则，主张返还财产或折价补偿。

   • 若协议有效：您有权依据协议约定，要求工程公司履行义务（如支付工程款、返还保证金等），并在破产程序中申报债权。
     
   • 若协议无效：您可主张工程公司返还因挂靠取得的财产（如管理费、保证金等），或要求赔偿实际损失（如已投入的工程成本）。

2. 及时申报债权，参与破产程序
   工程公司破产时，您需在法院规定的债权申报期限内，向破产管理人提交债权申报材料，包括：

   • 挂靠协议、工程合同、付款凭证等证明债权存在的证据；
     
   • 债权金额计算依据（如未结工程款、违约金、损失赔偿等）；
     
   • 工程公司已确认债权的书面文件（如有）。
     注意：若您未在期限内申报债权，可能丧失在破产程序中受偿的权利，但可在破产程序终结后，通过诉讼或仲裁主张权利（但受偿难度大幅增加）。

3. 区分债权性质，争取优先受偿
   根据《企业破产法》及相关司法解释，您的债权可能属于以下类型，受偿顺序不同：

   • 优先债权：若您对工程公司的特定财产享有抵押权、质权等担保物权，可就该财产优先受偿；
     
   • 建设工程价款优先受偿权：若您是实际施工人，且工程已竣工或具备结算条件，可依据《民法典》第807条，主张对工程折价或拍卖价款优先受偿（优先于抵押权和其他债权）；
     
   • 普通债权：若您的债权无担保且不属于建设工程价款，则按破产财产分配方案与其他普通债权人按比例受偿。
     建议：尽快收集证据证明您符合优先受偿条件（如实际施工人身份、工程验收证明等），并向破产管理人主张权利。

4. 追究相关方责任，扩大追偿范围
   若工程公司破产是由于发包方未支付工程款导致，您可依据《民法典》及司法解释，直接向发包方主张权利：

   • 若发包方明知挂靠关系：您有权要求发包方在欠付工程款范围内承担责任；
     
   • 若发包方不知情：您仍可依据实际施工人身份，突破合同相对性，向发包方主张工程款（但需证明您是实际投入资金、材料和劳力的主体）。
     此外：若工程公司股东存在抽逃出资、未履行出资义务等行为，您可要求股东在未出资范围内对公司债务承担补充赔偿责任。

5. 防范风险，提前采取保全措施
   在工程公司破产前，若您发现其有转移财产、逃避债务等迹象，可依法申请诉前财产保全或诉讼保全，冻结其银行账户、查封房产或设备等，确保后续执行有财产可供分配。
   注意：保全需提供担保，且需在法定期限内提起诉讼或仲裁，否则保全措施将自动解除。

总结：工程公司破产时，您需通过确认协议效力、申报债权、主张优先受偿权、追究相关方责任等途径维护权益。建议尽快委托律师介入，全面梳理证据、制定策略，以最大限度挽回损失。如有进一步问题，可直接向我咨询。