使用假章申办营业执照被发现，将会面临一系列严重的法律后果。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国公司法》及相关行政法规，使用假章申办营业执照属于违法行为。一旦被发现，市场监管部门有权对公司进行行政处罚，包括但不限于罚款、吊销营业执照等。罚款的数额会根据违法行为的严重程度和造成的后果来决定，可能相当可观。
   • 此外，公司还可能被列入经营异常名录或严重违法失信企业名单，这将对公司未来的经营和信誉造成极大影响。

2. 刑事责任：

   • 如果使用假章的行为构成犯罪，如伪造公司印章罪，那么相关责任人将面临刑事追究。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，伪造公司印章的，可能处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金。
   • 刑事责任不仅会对个人造成极大的法律后果，还会对公司的声誉和未来发展带来不可逆转的损害。

3. 民事责任：

   • 使用假章申办营业执照还可能引发民事纠纷。例如，如果公司因此与第三方签订了合同，而合同因假章问题被认定为无效，那么公司可能需要承担违约责任，赔偿对方因此遭受的损失。
   • 此外，如果公司因假章问题导致股东、债权人等利益相关者的权益受损，他们也可能通过法律途径追究公司的民事责任。

4. 信用惩戒：

   • 在现代社会，信用体系日益完善。使用假章申办营业执照的行为一旦被记录在信用系统中，将对公司的信用评级产生负面影响。这将影响公司未来的融资、合作、招投标等各个方面，甚至可能导致公司被市场淘汰。

法律建议：

• 如果公司已经或可能面临使用假章申办营业执照的问题，应立即停止相关行为，并主动向市场监管部门报告情况，配合调查处理。
• 公司应加强内部管理，完善印章使用制度，确保印章的真实性和合法性。同时，加强对员工的法律教育和培训，提高法律意识，避免类似问题的再次发生。
• 如果公司已经因此遭受了损失或面临法律纠纷，应及时咨询专业律师，制定合适的应对策略，以最大程度地减少损失和风险。

总之，使用假章申办营业执照是一种严重的违法行为，将面临行政处罚、刑事责任、民事责任和信用惩戒等多重后果。公司应严格遵守法律法规，加强内部管理，确保合法合规经营。如有任何法律问题或疑虑，请直接向我咨询。