关于高标准农田建设过程中果树是否有赔偿的问题，这主要取决于果树种植是否合法以及农田被征收或破坏的具体情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、基本农田的用途与保护原则
高标准农田，作为基本农田的一种，是受到严格保护的土地资源，其主要用途应限定为粮、棉、油、蔬菜等农产品生产。根据相关法律法规，擅自改变基本农田用途，如种植果树，通常被视为违法行为。因此，在一般情况下，对于违规种植的果树，并不存在所谓的“赔偿”。
二、政府合法征收情况下的补偿机制
若政府因公共利益建设等合理原因需要合法征收高标准农田，并且导致原本在农田上种植的果树需要被清理，那么根据相关法律法规，您是有权获得相应补偿的。补偿通常包括以下几个方面：
土地补偿费：这是根据被征收前三年平均年产值的一定倍数来计算的，具体倍数会由地区根据自身经济发展水平和土地产值等因素来确定，通常在6到10倍之间。
地上附着物补偿费：针对果树，这部分补偿会考虑果树的种类、树龄、数量及生长情况，通过专业评估机构按市场价值等方法确定每株果树的补偿价格，再乘以总数得出总额。
安置补助费：这是按需要安置的农业人口数来计算的，标准为该基本农田被征收前三年平均年产值的4到6倍。但需要注意的是，每公顷被征收农田的安置补助费最高不得超过前三年平均年产值的15倍。
三、他人非法破坏情况下的赔偿途径
若您的果树是因他人非法破坏而遭受损失，那么这构成民事侵权行为。在此情况下，您有权要求侵权方承担赔偿责任，赔偿范围包括果树本身的价值损失以及预期收益损失。果树本身的价值损失会考虑树龄、品种、产量等因素，按果树实际价值确定；而预期收益损失则是指若有证据证明因果树被破坏导致未来一定时期内预期收获的果实等收益无法实现，也应予以赔偿。您可以通过协商、调解或向法院提起民事诉讼等方式来维护自己的权益。
四、违法种植的后果与处理建议
对于擅自在高标准农田上种植果树的行为，可能会面临恢复原状的费用、罚款以及其他损失赔偿等法律后果。因此，我建议您在处理涉及高标准农田的问题时，务必遵守相关法律法规和政策要求。如果您对具体的政策法规和要求不了解，建议尽快咨询当地的农业部门或土地管理部门以获取准确信息。如需法律帮助或咨询，也可寻求专业律师的支持和指导。
综上所述，高标准农田建设过程中果树是否有赔偿取决于多种因素。希望以上解答能对您有所帮助。