当电瓶自行车（电动车）闯红灯被电子眼抓拍后，车主需要按照以下步骤来处理并了解相应的处罚措施：
一、确认违章信息
首先，您需要确认抓拍的真实性以及违章的具体信息，这包括违章时间、地点、行为（闯红灯）以及罚款金额等。您可以通过以下几种方式来查询：
- 访问当地交通管理部门的官方网站或使用官方APP（如“交管12123”），在相关板块中输入车辆信息或违章记录编号进行查询。
- 前往当地交警大队或交通监控中心，携带身份证、电动车行驶证等相关证件，由工作人员协助查询并确认违章信息。
- 如果您收到了违法通知单，上面也会详细列出违章信息，您可以仔细核对。
二、了解处罚措施
电瓶自行车闯红灯的处罚通常包括罚款，具体罚款金额根据当地交通法规而定。在某些地区，还可能伴随扣分（如果电动车被纳入机动车管理范畴）或其他处罚措施。因此，在确认违章信息后，您需要了解具体的处罚内容。
三、选择缴纳方式
确认了违章信息和处罚措施后，您需要按照规定的时间去指定的部门进行罚款缴纳。缴纳方式主要分为线上和线下两种：
线上缴纳：
- 使用交通管理部门指定的APP（如“交管12123”），注册登录后绑定电动车信息，在“违法处理”选项下找到闯红灯的记录，确认信息后选择支付方式完成罚款缴纳。
- 通过当地政务服务平台或微信、支付宝等生活缴费渠道进行缴纳。在相关平台中找到“交通违法缴罚”选项，输入车辆信息和违法决定书编号，确认后完成缴费。
线下缴纳：
- 携带身份证、电动车行驶证及违法通知单前往指定银行网点进行缴纳。请确认该银行网点是否支持缴纳交通违法罚款，并按照银行工作人员指引完成缴纳。
- 前往当地交警大队违法处理窗口，携带相关证件由工作人员查询并确认违法记录后直接缴纳罚款。
四、缴纳罚款后的注意事项
- 缴纳罚款后，请务必保留好缴费凭证或回执单，以便日后查询或作为证明之用。
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，当事人应当自收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内缴纳罚款。逾期不缴纳的，每日按罚款数额的百分之三加处罚款，但加处罚款的总额不得超出罚款的数额。因此，请务必在规定时间内完成缴纳。
五、异议处理
如果您对电子眼拍到的违章记录有疑问或异议，可以向当地交通管理部门咨询或申诉。申诉时需提供相关证据和理由，如照片、视频等，以便交通管理部门进行核实和处理。
综上所述，电瓶自行车闯红灯被电子眼抓拍后，车主应及时确认违章信息、了解处罚措施、选择合适的缴纳方式在法定期限内完成罚款缴纳，并保留好缴费凭证。如有异议，及时向交通管理部门咨询或申诉。