结论：是否让持股49%的妻子担任法人，需结合公司实际情况、股东间信任关系及法律风险综合考量，以下从不同角度为您分析：
一、法律层面：法人资格与股权比例无必然联系
法人定义
根据《公司法》第十三条，法定代表人由董事长、执行董事或经理担任，其职责是代表公司对外签署文件、参与诉讼等。法律未规定法定代表人必须由控股股东担任，因此持股比例（如您51%、妻子49%）与是否担任法人无直接关联。
法定代表人权利与义务
- 权利：代表公司行使职权（如签订合同、参与诉讼）。
- 义务：若公司存在违法行为（如偷税漏税、非法经营），法定代表人可能被追究行政或刑事责任（《民法典》第六十二条）。
关键点：若妻子担任法人，您作为控股股东仍需通过公司章程或股东会决议对其职权进行约束，避免因法人个人行为导致公司承担风险。
二、实务层面：需权衡利弊
优势
- 信任基础：若夫妻间高度信任，妻子担任法人可简化决策流程（如日常经营签字）。
- 税务筹划：部分地区对法人个人所得税有优惠政策，可结合家庭财务规划考虑。
- 风险隔离：若您作为控股股东不直接参与经营，由妻子担任法人可降低您因公司债务被牵连的风险（但需注意《公司法》第二十条“法人人格否认”制度，若股东滥用权利逃避债务，仍可能被追责）。
风险
- 个人责任：若公司违法经营，妻子作为法人可能被限制高消费、列入失信名单，甚至承担刑事责任（如单位犯罪时直接负责的主管人员）。
- 家庭财产混同：若公司财务与家庭财产未严格区分，妻子作为法人可能面临“刺破公司面纱”风险，导致家庭财产被用于偿债。
- 股权争议：若未来夫妻关系变化（如离婚），妻子作为法人可能利用职权阻碍公司正常运营（如拒绝签字、转移资产）。
三、操作建议
明确权责
- 通过公司章程或股东协议约定法定代表人的职权范围（如单笔合同金额限制、对外担保审批流程）。
- 要求妻子签署《承诺书》，明确其仅代表公司行使职权，不得以个人名义损害公司利益。
风险防控
- 购买董监高责任险：为妻子（作为法人）投保，转移因职务行为导致的赔偿风险。
- 财务隔离：确保公司账户与家庭账户独立，避免财产混同。
- 定期审计：委托第三方机构对公司财务进行审计，防止法人滥用职权。
替代方案
- 若担心风险，可由您担任法人，妻子通过股东会决议参与经营决策（如担任经理）。
- 或委托职业经理人担任法人，您和妻子作为股东通过章程约束其行为。
总结：让妻子担任法人并非法律禁止，但需结合公司规模、行业风险及夫妻关系稳定性综合判断。建议优先通过制度设计（如章程、协议）明确权责，并配套风险防控措施。若有具体行业或公司类型（如科技公司、家族企业），可进一步向我咨询细化方案。