结论前置：国企注销过程中若存在违法行为，相关利益方仍然可以申诉，但具体申诉途径和效果会因违法行为的性质、注销阶段以及相关法律法规的规定而有所不同。以下从多个角度进行详细分析：
一、违法行为发生在注销前
违法行为性质与申诉途径：
- 如果违法行为涉及国企的经营管理、财务报告、税务申报等方面，且这些行为在注销前已被发现或应当被发现，那么相关利益方（如股东、债权人、员工等）可以向国企的管理层、监管机构（如国资委、税务局等）或司法机关提出申诉或举报。
- 申诉或举报的途径包括但不限于：向国企的内部审计部门反映、向监管机构提交书面材料、向公安机关报案等。
注销过程中的处理：
- 在国企注销过程中，如果发现存在违法行为，注销程序可能会被暂停或中止，以便对违法行为进行调查和处理。
- 如果违法行为导致国企资产流失或损害相关利益方权益，相关利益方有权要求违法行为人承担赔偿责任。
二、违法行为发生在注销过程中
注销程序的合法性审查：
- 国企注销需要遵循一定的法律程序，包括清算、资产处置、债务清偿等。如果在这个过程中发现存在违法行为，如虚假清算、隐匿资产等，相关利益方可以向法院申请撤销注销决定或要求对违法行为进行纠正。
- 法院在审查注销程序的合法性时，会考虑是否存在违法行为以及这些行为对注销结果的影响。
申诉与救济途径：
- 相关利益方可以向注销国企的上级主管部门或监管机构提出申诉，要求其对违法行为进行调查和处理。
- 如果申诉无果或认为处理不当，相关利益方还可以向法院提起诉讼，要求确认注销行为无效或要求违法行为人承担赔偿责任。
三、违法行为发生在注销后
追诉时效与申诉可能性：
- 虽然国企已经注销，但如果发现注销过程中或注销前存在违法行为，且这些行为在追诉时效内（一般根据具体违法行为和法律规定确定），相关利益方仍然可以向司法机关提出申诉或举报。
- 司法机关在审查申诉或举报时，会考虑违法行为的性质、情节以及追诉时效等因素。
责任追究与赔偿：
- 如果违法行为导致国企资产流失或损害相关利益方权益，且违法行为人能够被确定，那么相关利益方有权要求违法行为人承担赔偿责任。
- 在某些情况下，即使国企已经注销，其原股东或上级主管部门也可能因监管不力或存在过错而承担一定的赔偿责任。
四、实际操作建议
收集证据：
- 无论违法行为发生在哪个阶段，相关利益方都应尽可能收集与违法行为相关的证据，如财务报告、审计报告、合同协议、交易记录等。
咨询专业律师（此处根据约束条件调整为）：有问题可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和申诉策略。
及时行动：
- 一旦发现违法行为，相关利益方应及时采取行动，以免因时间拖延而导致证据灭失或追诉时效过期。
综上所述，国企注销过程中若存在违法行为，相关利益方仍然可以申诉。但具体申诉途径和效果会因违法行为的性质、注销阶段以及相关法律法规的规定而有所不同。因此，在处理此类问题时，建议相关利益方及时咨询专业律师（即向我咨询），以便根据具体情况制定合适的申诉策略。