虚开增值税专用发票罪在一般情况下不能直接适用轻罪封存制度，但在符合特定条件时，可能通过其他方式实现类似效果。以下从不同角度详细分析：

1. 轻罪封存制度的适用范围
   轻罪封存制度（或称“犯罪记录封存”）通常适用于未成年人犯罪或情节轻微、社会危害性较小的成年犯罪。根据《刑事诉讼法》第286条，犯罪时不满十八周岁且被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。而虚开增值税专用发票罪的法定刑为三年以下有期徒刑或拘役（情节较轻时）至十年以上有期徒刑或无期徒刑（情节严重时），若行为人被判处五年以下有期徒刑且符合其他条件（如认罪认罚、退赃退赔等），理论上可能适用封存，但实践中需严格审查情节。

2. 虚开增值税专用发票罪的特殊性
   该罪属于危害税收征管的严重经济犯罪，直接破坏国家税收秩序和财政收入。即使涉案金额较小或情节较轻，司法机关也会综合考虑犯罪动机、手段、后果等因素。若案件涉及虚开税款数额较大、造成国家税款损失严重，或存在团伙作案、多次虚开等情节，即使最终量刑在五年以下，也可能因社会危害性较大而被排除在封存范围外。

3. 替代性救济途径
   若不符合轻罪封存条件，行为人仍可通过以下方式减轻影响：

   • 缓刑适用：若被判处三年以下有期徒刑且符合缓刑条件（如认罪悔罪、无再犯危险等），可避免实际监禁，减少对个人生活的负面影响。
     
   • 刑罚执行完毕后申请封存：部分地区试点对成年犯罪人刑罚执行完毕满一定期限（如五年）且无再犯的，可申请封存非暴力犯罪记录，但需以地方性法规为依据。
     
   • 行政处罚替代：若虚开行为未达到刑事立案标准，可能仅受行政处罚（如罚款、补缴税款），不会留下犯罪记录。

4. 实务建议

   • 争取从宽处理：在侦查、审查起诉阶段积极配合调查，退还违法所得、补缴税款，争取认定为“情节轻微”或适用认罪认罚从宽制度，以降低量刑幅度。
     
   • 关注地方政策：部分省份对特定经济犯罪出台了封存或赦免政策（如浙江对民营企业经营者犯罪的封存试点），可结合案发地政策争取权益。
     
   • 长期合规建设：若企业涉及此类犯罪，需完善税务合规制度，避免再次涉险，同时可通过公益活动、社区服务等方式修复社会关系，为未来申请封存或赦免积累条件。

总结：虚开增值税专用发票罪能否封存需结合量刑、情节、主体身份及地方政策综合判断。若您或您的企业涉及此类案件，建议提供具体案情（如虚开税款数额、是否退赃、主观恶性等），以便进一步分析法律风险及应对策略。