结论：还房抵银行卡里有钱但扣了一部分没扣够，是否算逾期需分情况讨论，主要取决于贷款合同中的具体约定以及银行的实际操作。
分析说明：
贷款合同约定：
- 明确约定：如果贷款合同中明确规定了还款金额、还款日期以及还款方式，并且明确指出若还款金额不足则视为逾期，那么在这种情况下，即使银行卡里有钱但扣了一部分没扣够，也会被视为逾期。
- 未明确约定：如果贷款合同中没有明确规定还款金额不足即视为逾期，或者对逾期的定义较为模糊，那么这种情况是否算逾期就需要结合银行的实际操作和行业惯例来判断。
银行实际操作：
- 自动扣款系统：银行通常设有自动扣款系统，用于在还款日自动从借款人银行卡中扣除应还款项。如果系统因某种原因（如银行卡余额不足、系统故障等）未能全额扣款，银行可能会根据合同约定或内部规定采取相应措施，包括但不限于发送逾期通知、收取逾期利息或罚息等。
- 人工处理：在某些情况下，银行可能会通过人工方式处理还款事宜。如果借款人因特殊原因（如资金暂时短缺）未能全额还款，但及时与银行沟通并说明了情况，银行可能会根据实际情况给予一定的宽限期或采取其他灵活措施。
行业惯例与法律法规：
- 行业惯例：在金融行业中，对于还款金额不足的情况，通常会有一定的处理流程和规定。这些惯例可能因银行而异，但一般会倾向于保护借款人的合法权益，同时确保银行的资金安全。
- 法律法规：根据相关法律法规，银行在处理借款人还款事宜时应当遵循公平、公正、透明的原则。如果银行因自身原因（如系统故障）导致未能全额扣款，且未及时通知借款人，那么借款人可能有权要求银行承担相应的责任。
法律建议：
- 查阅贷款合同：首先，建议您仔细查阅贷款合同中的相关条款，特别是关于还款金额、还款日期以及逾期定义的部分。这有助于您明确自己的权利和义务。
- 与银行沟通：如果您发现银行卡里有钱但扣了一部分没扣够，且担心这可能会影响您的信用记录或产生逾期费用，建议您及时与银行沟通并说明情况。银行可能会根据您的实际情况给予相应的帮助或建议。
- 保留证据：在与银行沟通的过程中，建议您保留好相关的证据（如通话记录、短信通知等），以便在需要时证明自己的还款意愿和实际情况。
可能后果：
- 信用记录受损：如果银行将此次还款视为逾期，并上报至征信机构，那么您的信用记录可能会受到影响。这可能会对您未来的贷款申请、信用卡申请等产生不利影响。
- 产生逾期费用：根据贷款合同的约定，银行可能会对逾期还款收取逾期利息或罚息。这将增加您的还款负担。
特殊场景：
- 系统故障：如果银行系统因故障导致未能全额扣款，且银行未能及时通知您，那么您可能有权要求银行免除因此产生的逾期费用或罚息。但您需要提供相应的证据来证明这一点。
- 不可抗力：在极少数情况下，如自然灾害、战争等不可抗力事件导致您无法按时全额还款，您可能需要根据贷款合同的约定或相关法律法规的规定来寻求相应的减免或宽限。
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