结论：在合同纠纷中，说明材料里写的是“合同”但提供的材料是“协议”，这一情况本身并不直接导致问题，关键在于“协议”是否满足合同的法律要件以及双方的真实意思表示。以下从多个角度进行详细分析：
合同与协议的法律定义及关系：
- 合同：在法律上，合同是双方或多方之间设立、变更、终止民事关系的协议。它通常包含明确的条款，如双方的权利和义务、违约责任等，并受到法律的保护和约束。
- 协议：协议在广义上也可以被视为合同的一种形式，它同样表示双方或多方之间的合意。协议可能更加灵活，不一定包含所有合同要素，但只要双方意思表示真实，且不违反法律强制性规定，同样具有法律效力。
- 关系：从法律角度看，合同和协议在本质上并无显著差异，都是双方或多方之间达成的一种合意。因此，在说明材料中写“合同”而提供“协议”并不构成法律上的障碍，关键在于协议的内容是否满足合同的法律要件。
协议作为合同的有效性：
- 内容完整性：如果提供的“协议”包含了合同的主要条款，如双方的身份信息、标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式、违约责任等，且双方意思表示真实，那么该协议可以被视为有效的合同。
- 形式要求：根据《民法典》的相关规定，某些类型的合同可能需要采用书面形式或其他特定形式。如果协议符合这些形式要求，那么它同样具有法律效力。
- 法律认可：只要协议不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方自愿签署，那么该协议在法律上就是有效的，可以作为合同纠纷的依据。
实际操作中的建议：
- 核对协议内容：在提交说明材料时，应仔细核对协议的内容，确保其包含了合同的主要条款，且双方意思表示真实。
- 明确协议性质：如果协议在形式上或内容上与常规的合同有所差异，可以在说明材料中明确其性质，解释为何该协议可以被视为有效的合同。
- 咨询专业律师：在涉及合同纠纷时，如果对方对协议的效力提出质疑，或者自己对协议的法律性质存在疑问，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
总结与进一步思考：在合同纠纷中，说明材料里写的是“合同”但提供的材料是“协议”并不构成法律上的问题。关键在于协议是否满足合同的法律要件以及双方的真实意思表示。如果协议内容完整、形式合法，且双方自愿签署，那么它同样具有法律效力。在处理此类纠纷时，应仔细核对协议内容，明确其性质，并在必要时咨询专业律师。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。