结论：法院查封了四十万房产后是否会拍卖，取决于多种因素，包括被执行人是否履行了赔偿义务、房产是否为被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋等。以下是对这些因素的详细分析：
被执行人是否履行了赔偿义务：
- 如果被执行人（即车祸中的责任方）已经按照法院判决或调解的结果，全额或部分履行了100万的民事赔偿义务，那么法院通常不会对已查封的房产进行拍卖。因为拍卖房产的主要目的是为了执行判决，确保赔偿义务得到履行。
- 如果被执行人未履行赔偿义务，且没有其他可供执行的财产，那么法院可能会考虑拍卖已查封的房产，以用拍卖所得来履行赔偿义务。
房产是否为被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋：
- 根据相关法律规定，如果被查封的房产是被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，那么法院在拍卖时可能会更加谨慎。在某些情况下，法院可能会选择不拍卖该房产，或者要求被执行人提供其他居住房屋的证明，以确保被执行人及其家属的基本居住需求得到满足。
- 如果该房产并非被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，或者被执行人能够提供其他居住房屋的证明，那么法院更有可能决定拍卖该房产。
其他执行措施和协商情况：
- 在决定是否拍卖房产之前，法院可能会考虑采取其他执行措施，如冻结被执行人的银行账户、扣押其其他财产等。如果这些措施能够确保赔偿义务得到履行，那么法院可能会选择不拍卖房产。
- 此外，如果双方当事人能够达成和解协议，被执行人同意以其他方式履行赔偿义务（如分期付款、提供担保等），那么法院也可能会根据和解协议的内容，决定不拍卖已查封的房产。
建议：
- 如果您是车祸中的受害方，且担心赔偿义务无法得到履行，您可以向法院申请强制执行，并提供被执行人的财产线索。法院在查封房产后，会根据上述因素综合考虑是否拍卖。
- 如果您是车祸中的责任方，且担心房产被拍卖，您可以尽快履行赔偿义务，或者与受害方协商达成和解协议。这样不仅可以避免房产被拍卖，还可以减少因诉讼而产生的额外费用和时间成本。
法律背景：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，法院在执行判决时，有权查封、扣押、冻结被执行人的财产，并可以根据需要拍卖、变卖这些财产以履行判决。
- 同时，法律也规定了保护被执行人及其所扶养家属基本生活需求的条款，如不得拍卖被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋等。
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