关于您提出的“中介扣临床试验补贴是否合法”的问题，这需要从多个角度来进行分析和解答。

首先，我们要明确的是，临床试验受试者所获得的补助，其性质通常被视为劳务报酬。根据《中华人民共和国个人所得税法》的相关规定，劳务报酬所得是需要缴纳个人所得税的。因此，如果中介在发放补贴时扣除了个人所得税，这一行为本身在税务层面是合法的，但前提是扣除的税额必须准确无误，且符合税法规定。

然而，您所提到的“中介扣临床试验补贴”可能不仅仅涉及个人所得税的扣除。如果中介在未经受试者同意的情况下，擅自扣除了除税款以外的其他费用，或者扣除的税额超过了法定标准，那么这种行为就是不合法的。

为了更具体地解答您的问题，我们可以从以下几个方面进行深入分析：

1. 补贴的性质与税务处理：

   • 临床试验受试者补助通常被视为劳务报酬，需要缴纳个人所得税。
   • 中介在发放补贴时，有义务按照税法规定扣除应缴纳的税款。

2. 中介的扣除权限与范围：

   • 中介作为补贴的发放者，其扣除权限应严格限于税法规定的范围。
   • 除非有明确的合同约定或法律授权，否则中介无权擅自扣除其他费用。

3. 受试者的权益保护：

   • 受试者有权了解补贴的具体构成和扣除情况。
   • 如果受试者对中介的扣除行为有异议，可以通过合法途径进行维权。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 在参与临床试验前，受试者应仔细阅读并理解相关合同和协议，特别是关于补贴发放和扣除的条款。
   • 如果发现中介存在不合法扣除行为，受试者应及时向相关部门投诉或寻求法律援助。

综上所述，中介在发放临床试验补贴时扣除个人所得税是合法的，但必须确保扣除的税额准确无误且符合税法规定。如果中介擅自扣除了其他费用或超过了法定扣除标准，那么这种行为就是不合法的。作为受试者，您有权了解补贴的具体构成和扣除情况，并在必要时通过合法途径进行维权。