询问证人本身不会留下案底，但具体是否留下案底还需根据询问的性质以及后续的处理结果来判断。以下从多个角度进行详细分析：
一、询问证人的性质
一般询问（作为证人或知情人）：
- 如果只是作为证人或知情人接受公安机关的询问，配合调查案件事实，并未涉及任何违法犯罪行为，那么这种询问不会留下案底。
- 此类询问的目的是为了获取案件相关信息，协助公安机关查明事实真相，证人只是履行公民义务，提供自己所了解的情况。
涉嫌违法犯罪的询问（但最终未认定有罪）：
- 如果因某种原因被公安机关怀疑涉嫌违法犯罪行为而被传唤或询问，但经过调查后，未被认定为违法犯罪，或者案件被撤销、不起诉、终止审理等，那么也不会留下案底。
- 在这种情况下，虽然经历了询问过程，但由于最终未被认定有罪，因此不会产生犯罪记录。
二、案底的定义与影响
案底的定义：
- 案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度。
- 在我国法律中，案底通常指的是有过刑事犯罪前科的档案记录，这些记录存放在公安部门与相关国家机关。
案底的影响：
- 有案底的人在升学、入伍、就业等方面可能会受到限制，例如不能从事某些特定职业（如法官、检察官、公务员等）。
- 案底还可能对个人及子女产生长远影响，如子女在报考军校、警校等特殊院校时可能因政审不通过而受限。
三、特殊情况说明
作伪证的情况：
- 如果证人在作证过程中故意作虚假证明，意图陷害他人或者隐匿罪证，且情节严重，那么这种行为可能构成伪证罪。
- 一旦被判定有罪，证人将会留下案底，并承担相应的刑事责任。
行政处罚与刑事处罚的区别：
- 行政处罚（如警告、罚款、行政拘留等）不会留下案底，但会在公安机关留下违法记录。
- 刑事处罚则会留下案底，对个人产生长期影响。因此，即使作为证人被询问，如果因作伪证等行为受到刑事处罚，也会留下案底。
四、建议与总结
- 作为证人应如实作证：证人应如实提供自己所了解的案件情况，这是履行公民义务的行为，也是协助司法机关查明案件事实的重要途径。
- 了解法律后果：证人应了解作伪证等行为的法律后果，避免因一时疏忽或故意行为而给自己带来不必要的麻烦。
- 咨询专业律师：如果对询问过程或后续处理结果有任何疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
综上所述，询问证人本身不会留下案底，但具体是否留下案底还需根据询问的性质以及后续的处理结果来判断。作为证人，应如实作证，了解法律后果，并在必要时咨询专业律师。