合同中开办费的计算需结合合同约定、费用性质及法律规定综合判断，具体分以下情况处理：

1. 合同有明确约定时
   若合同中已约定开办费的计算方式（如按项目总价比例、固定金额或实际发生额报销），则直接按合同条款执行。例如：合同约定“开办费为项目总价的5%”，则直接按总价乘以比例计算。
   注意：需审查合同条款是否合法有效（如无显失公平、欺诈等情形），若约定模糊或存在争议，可结合交易习惯或补充协议明确。

2. 合同未约定但实际发生时
   若合同未约定开办费，但一方实际支出了合理费用（如筹备期人员工资、场地租赁、设备采购等），可主张按实际发生额补偿，但需满足以下条件：

   • 费用合理性：需证明费用与合同履行直接相关（如为履行合同而专门采购的设备）；
     
   • 提前告知义务：若费用需对方承担，应提前通知并经对方确认（如邮件、签字确认单）；
     
   • 举证责任：需保留发票、合同、付款凭证等证据，否则可能因证据不足被驳回。

3. 法律对开办费的限制

   • 格式条款无效情形：若合同中“开办费由一方全部承担”的条款属于格式条款（如重复使用、未提示对方注意），且显失公平（如费用远超行业惯例），可能被认定为无效；
     
   • 禁止性规定：若费用涉及商业贿赂、非法转包等违法行为，即使合同有约定，也可能被法院或仲裁机构不予支持。

实务建议：

• 签订合同前，明确开办费的承担主体、计算方式及支付时间，避免模糊表述；
  
• 费用发生时，及时与对方沟通并留存书面确认文件；
  
• 争议发生后，优先通过协商或调解解决，若协商不成，可依据合同约定向法院起诉或申请仲裁。
  

如有具体合同条款或费用明细需要分析，可直接向我咨询。