结论：诈骗5000元被立案，若您是受害者，则不会留下案底；若您是实施诈骗的犯罪嫌疑人，则可能会留下案底。

详细分析：

1. 受害者身份：

   • 当您成为诈骗案件的受害者，并因诈骗5000元而报警立案时，您的身份是报案人，而非犯罪嫌疑人。
   • 报案行为是为了维护自身合法权益，协助公安机关打击犯罪。在此情况下，您不会留下案底。
   • 法律依据：案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，在我国法律中，主要指有过刑事犯罪前科的档案记录。作为受害者，您并未犯法或犯罪，因此不会留下案底。

2. 犯罪嫌疑人身份：

   • 若您因诈骗5000元而被公安机关立案侦查，并最终被认定为犯罪嫌疑人，那么根据案件的最终处理结果，您可能会留下案底。
   • 具体情形：
     • 如果案件经过侦查、起诉、审判等程序，最终您被法院判定有罪，那么您将留下刑事犯罪前科，即案底。
     • 如果案件在侦查阶段因证据不足等原因被撤销，或者您被检察院决定不起诉，或者法院判决您无罪，那么您不会留下案底。但需要注意的是，即使案件被撤销或不起诉，您的个人信息和案件情况仍可能被公安机关记录在案，但这并不等同于案底。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，未经人民法院依法判决，对任何人都不得确定有罪。因此，只有法院判决有罪后，才会留下案底。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果您在配合调查过程中存在违法行为，如提供虚假证言、妨碍作证等，那么您可能会面临相应的法律责任和处罚，但这与诈骗案件本身是否留下案底无关。
   • 建议：在配合调查时，务必如实陈述事实，提供真实证据，以维护自身合法权益和避免不必要的法律风险。

总结与建议：

• 如果您是诈骗案件的受害者，无需担心留下案底的问题。您应积极配合公安机关的调查工作，提供相关证据和信息，以便尽快追回损失并打击犯罪。
• 如果您因诈骗行为而被立案侦查，建议您及时咨询专业律师（如我，董云峰律师，专注于刑事辩护领域），了解您的权利和义务，以及案件的可能走向和后果。在律师的指导下，您可以更好地应对调查和审判程序，维护自身合法权益。
• 无论您是受害者还是犯罪嫌疑人，都应遵守法律法规，如实陈述事实，提供真实证据。这是维护自身合法权益和避免法律风险的基础。