评估公司适用废止估价依据作出的评估报告是不合法的。以下从几个方面进行详细分析：

1. 法律依据的时效性：

   • 法律、法规以及各类规范性文件都有其特定的生效和废止时间。一旦某个估价依据被废止，就意味着它不再具有法律效力，不能作为评估活动的合法依据。
   • 评估公司在进行评估时，必须依据现行有效的法律、法规和规范性文件进行。如果使用了废止的估价依据，那么评估报告就缺乏了合法的依据，其合法性自然受到质疑。

2. 评估报告的合法性要求：

   • 评估报告作为具有法律效力的文件，必须满足合法性的要求。这包括评估依据的合法性、评估程序的合法性以及评估结论的合理性等。
   • 如果评估公司使用了废止的估价依据，那么评估报告在合法性上就存在瑕疵，可能无法被相关机构或法院所采纳。

3. 可能的法律后果：

   • 对于评估公司而言，使用废止的估价依据进行评估可能面临行政处罚、民事赔偿等法律责任。因为这种行为可能损害了相关当事人的合法权益，破坏了市场的公平竞争秩序。
   • 对于依赖评估报告进行决策的相关方（如投资者、金融机构等），如果因为评估报告的不合法性而遭受了损失，他们有权要求评估公司承担相应的赔偿责任。

4. 实际操作中的建议：

   • 评估公司在进行评估前，应仔细核查所使用的估价依据是否现行有效，避免使用废止的估价依据。
   • 如果评估公司发现已经使用了废止的估价依据，应及时采取补救措施，如重新进行评估、出具补充报告等，以消除评估报告的不合法性。
   • 相关当事人在收到评估报告时，也应仔细审查评估报告的合法性，包括评估依据的时效性等，以确保自己的合法权益不受损害。

综上所述，评估公司适用废止估价依据作出的评估报告是不合法的。如果你在建设工程领域遇到了相关法律问题，或者对评估报告的合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。