车贷逾期时，贷款机构一般不能直接申请“封存车本”，但可通过法律程序对车辆采取查封、扣押等措施，具体需结合合同约定和法律程序判断。以下是详细分析：

1. “车本”的性质与归属
   “车本”通常指《机动车登记证书》（绿本），是车辆所有权的法律证明。根据《机动车登记规定》，车辆登记证书由车辆所有人保管，贷款购车时，若车辆已抵押给贷款机构，登记证书上会注明抵押权人信息，但证书本身仍由车主保管（部分地区可能要求抵押时交由贷款机构保管，需以合同约定为准）。

2. 贷款机构的权利边界

   • 合同约定优先：若贷款合同中明确约定“逾期时贷款机构有权扣押登记证书”，且该条款不违反法律强制性规定（如《民法典》第497条关于格式条款无效的情形），则贷款机构可能依据合同主张权利。
     
   • 无合同依据时：若合同未约定，贷款机构无权直接扣押或“封存”证书，否则可能构成侵权（侵犯物权或隐私权）。

3. 法律程序下的车辆处置
   即使贷款机构不能直接封存车本，若车主逾期未还款，贷款机构仍可通过法律途径维护权益：

   • 起诉并申请财产保全：贷款机构可向法院起诉，要求车主偿还贷款，并申请查封车辆（包括限制过户、抵押等），此时车辆登记证书可能被法院或车管所临时管控，但非由贷款机构“封存”。
     
   • 拍卖变现：若法院判决车主还款但未履行，贷款机构可申请强制执行，通过拍卖车辆优先受偿。

4. 车主的应对建议

   • 核查合同条款：确认贷款合同中是否约定了逾期时登记证书的处理方式，避免贷款机构单方面扩大权利。
     
   • 及时沟通协商：若因特殊原因逾期，建议主动与贷款机构协商还款计划，避免法律纠纷。
     
   • 保留证据：若贷款机构非法扣押证书，可留存沟通记录、报警回执等证据，通过法律途径主张返还或赔偿。

总结：车贷逾期时，贷款机构不能直接“封存车本”，但可通过合同约定或法律程序对车辆采取限制措施。车主需重点关注合同条款，并积极应对逾期问题，以维护自身权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。