核心结论：农村房子卖房协议丢失后，可通过补办、协商补签、收集其他证据或诉讼途径解决，具体如下：

1. 尝试补办或查找备份
   首先，应仔细回忆协议签订时的细节，例如是否通过村委会、中介机构或见证人协助办理。若协议曾由村委会备案或中介留存，可联系相关方调取备份文件。若协议为双方自行签订，可检查是否留有电子版（如邮件、聊天记录）或拍照存档，这些均可作为辅助证据。

2. 与对方协商补签协议
   若原协议无法找回，可与买方重新协商并签订补充协议，明确原协议内容（如交易价格、付款方式、房屋状况等）。补签时需注意：

   • 双方需对原协议条款无异议，避免因记忆偏差产生纠纷；
     
   • 补签协议应注明“因原协议丢失，现重新确认交易内容”，并由双方签字捺印；
     
   • 若涉及第三方（如村委会、见证人），可邀请其参与补签过程以增强证明力。

3. 收集其他证据证明交易事实
   若无法补办或补签协议，可通过以下证据证明交易真实性：

   • 付款凭证：如银行转账记录、收条等，证明买方已支付房款；
     
   • 房屋交付证据：如水电费缴纳记录、物业交接单等，证明房屋已实际交付；
     
   • 证人证言：如邻居、村委会成员等知情人的书面证言，证明双方存在买卖关系；
     
   • 其他书面材料：如买卖谈判记录、短信、微信聊天记录等，间接证明交易意图。

4. 通过诉讼确认房屋权属
   若双方对交易事实存在争议，且其他证据不足，可向法院提起诉讼，请求确认房屋买卖合同效力或要求对方履行合同义务。法院会根据双方陈述及现有证据综合判断，若认定交易真实存在，可能直接确认权属或责令补办手续。

风险提示：

• 农村房屋买卖可能涉及宅基地使用权转让问题，需确认交易是否符合《土地管理法》等规定（如是否为本村集体经济组织成员之间交易）；
  
• 若协议丢失后买方拒不承认交易，卖方可能面临房屋被侵占或无法追讨房款的风险，建议尽快通过法律途径解决；
  
• 日常交易中应妥善保管重要文件，建议对协议进行公证或备案，降低后续风险。

如有进一步疑问或需具体操作指导，可直接向我咨询。