药店套开发票供他人骗保属于违法行为，可能涉及保险诈骗罪和虚开发票罪，需承担刑事责任和行政处罚责任，具体处理方式如下：

1. 刑事责任层面
   根据《刑法》第198条，若药店与他人共谋通过套开发票虚构保险标的或夸大损失金额骗取保险金，可能构成保险诈骗罪的共犯。药店作为帮助犯，需根据其在犯罪中的作用承担相应责任，例如：

   • 若骗保金额达到“数额较大”（通常为1万元以上），可处5年以下有期徒刑或拘役，并处1万-10万元罚金；
     
   • 若金额“特别巨大”（通常为50万元以上），可处10年以上有期徒刑，并处2万-20万元罚金或没收财产。
     此外，若药店单独实施虚开发票行为（如为他人开具与实际经营不符的发票），可能触犯《刑法》第205条虚开发票罪，最高可处7年有期徒刑并处罚金。

2. 行政处罚层面
   即使未达到刑事立案标准，药店仍可能面临行政处罚：

   • 税务机关可依据《税收征收管理法》第63条，对药店偷税行为追缴税款、滞纳金，并处0.5倍至5倍罚款；
     
   • 市场监管部门可依据《发票管理办法》第37条，对虚开发票行为没收违法所得，并处5万-50万元罚款；
     
   • 医保部门可依据《医疗保障基金使用监督管理条例》第40条，暂停药店医保结算资格3-12个月，并处骗取金额2-5倍罚款。

3. 民事赔偿层面
   保险公司可依据《保险法》第27条，对骗保行为拒绝赔付并解除合同；若已赔付，可向药店追偿。此外，若骗保行为损害第三方权益（如患者因虚假用药记录延误治疗），药店还需承担民事侵权赔偿责任。

实务建议：

• 若您是药店经营者，应立即停止套开发票行为，主动向税务、医保部门说明情况并配合调查，争取从轻处理；
  
• 若您是受害者（如发现药店骗保导致自身权益受损），可向当地医保局举报（举报电话12393）或直接向公安机关报案；
  
• 若您已涉及此类案件，需尽快委托律师梳理资金流向、发票真实性等证据，评估是否构成单位犯罪或个人犯罪，制定辩护策略。
  

温馨提示：医疗保障基金是“救命钱”，任何套取行为均会面临严厉打击。如需进一步分析具体案情或制定应对方案，可随时向我咨询。