土地被侵占的诉讼时效问题，需根据具体情况区分民事诉讼时效和行政诉讼时效，以下为详细分析：

1. 民事诉讼时效

   • 一般规定：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这一时效从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。例如，若甲于2020年3月1日明确知晓乙侵占了其土地，则诉讼时效自该日起算，至2023年3月1日届满。

   • 特殊情况：

     • 诉讼时效的中断：在三年内，如果权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等法定事由发生，会导致诉讼时效中断，重新计算三年。如上述例子中，甲于2022年1月1日向乙发函要求停止侵占，则诉讼时效从该日重新起算。
     • 诉讼时效的中止：在最后六个月内，因不可抗力等原因导致权利人无法行使请求权的，诉讼时效中止。中止原因消除后，继续计算剩余的六个月。例如，若2022年11月1日因自然灾害导致甲无法主张权利，直至2023年2月1日灾害影响消除，则诉讼时效从2023年2月1日起继续计算六个月，至2023年8月1日届满。
     • 不适用诉讼时效的情形：根据《中华人民共和国民法典》第一百九十六条，请求停止侵害、排除妨碍、消除危险以及不动产物权和登记的动产物权的权利人请求返还财产等请求权，不适用诉讼时效的规定。这意味着，如果土地被侵占行为持续存在，权利人可随时请求法院责令侵占人停止侵害、排除妨碍或返还财产，不受三年时效的限制。但如果是基于土地侵权行为主张损害赔偿等债权请求权，则仍适用上述一般的诉讼时效规定。

2. 行政诉讼时效

   • 一般规定：对于土地侵占纠纷中的行政诉讼部分，根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，诉讼时效通常为六个月内提起。这意味着，如果土地被侵占涉及行政行为（如政府非法征地等），权利人需在知道或应当知道该行政行为之日起六个月内提起诉讼，否则可能丧失诉讼权利。

   • 最长保护期限：对于不动产案件，行政诉讼的最长保护期限为二十年。即自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

法律建议：

• 及时行动：权利人一旦发现土地被侵占，应立即采取行动，收集和保存好相关证据，并在法定期限内通过法律途径提起诉讼或申请仲裁，以保护自身合法权益。
• 区分请求权类型：在提起诉讼前，权利人应明确自己的请求权类型（如停止侵害、排除妨碍、返还财产或损害赔偿等），以便确定适用的诉讼时效规定。
• 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律分析和建议。

总结：土地被侵占的诉讼时效问题涉及多个法律层面和多种情形。权利人应根据自己的具体情况和请求权类型，选择合适的法律途径和诉讼时效规定来维护自己的合法权益。