许可证被吊销后，通常是由行政机关注销，而非当事人申请注销。以下从不同角度为你详细分析：
行政机关注销的法律依据与流程
法律依据：
- 根据相关法律法规，当行政机关依法吊销许可证后，该许可证即失去法律效力。行政机关有责任和义务对已吊销的许可证进行注销处理，以确保行政许可的严肃性和有效性。
注销流程：
- 行政机关在吊销许可证后，会按照规定的程序进行注销登记，包括在相关登记簿上记载注销事项、公告注销信息等。这一流程是行政机关的法定职责，不需要当事人提出申请。
当事人申请注销的特殊情况
当事人主动申请：
- 在某些特殊情况下，如当事人因业务调整、合并、分立等原因不再需要该许可证，且许可证未被吊销或撤销时，当事人可以主动向行政机关申请注销许可证。但这种情况与许可证被吊销后的注销是不同的。
配合行政机关工作：
- 即使许可证被吊销后由行政机关注销，当事人也有义务配合行政机关的工作，如提供必要的文件、资料等，以便行政机关顺利完成注销手续。
法律后果与注意事项
法律后果：
- 许可证被吊销后，当事人不得继续从事该许可证所许可的活动，否则将面临法律制裁。同时，行政机关的注销行为是对该许可证法律效力的最终确认，当事人应予以尊重并遵守。
注意事项：
- 当事人应密切关注行政机关的公告和通知，及时了解许可证的吊销和注销情况。
- 如对行政机关的吊销或注销决定有异议，当事人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
实际案例与启示
- 在实际案例中，曾有企业因违反相关法律法规被行政机关吊销许可证，后行政机关依法进行了注销处理。该企业未提出异议，并积极配合行政机关的工作，最终顺利完成了注销手续。这一案例启示我们，在面对许可证被吊销的情况时，当事人应理性对待，积极配合行政机关的工作，以维护自己的合法权益和企业的声誉。
综上所述，许可证被吊销后通常是由行政机关注销。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。