儿子租用父亲独资企业的车，在一般情况下是合法的，但需要满足一定的条件并遵循相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、合法性基础
合同自由原则：
- 在民事法律关系中，合同自由是一项基本原则。只要双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同即具有法律效力。
- 儿子作为承租人，父亲独资企业作为出租人，双方可以基于平等、自愿的原则签订车辆租赁合同。
企业财产独立原则：
- 父亲独资企业作为独立的法人实体（若已办理工商登记并取得法人资格），其财产独立于父亲的个人财产。
- 企业有权对其名下的车辆进行处分，包括出租给第三方，这里的第三方自然也包括企业的关联方，如儿子的个人使用。
二、需满足的条件
合同内容合法：
- 租赁合同应明确双方的权利义务，包括租赁期限、租金、车辆使用范围、维修责任等。
- 合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，如不得约定非法用途、不得逃避税收等。
租金合理：
- 租金应基于市场行情合理确定，避免过高或过低导致的不公平交易。
- 若租金明显低于市场价，可能被视为利益输送或逃避税收，从而引发法律风险。
税务合规：
- 租赁行为应依法纳税，包括增值税、企业所得税（如适用）等。
- 双方应保留好相关税务凭证，以备税务机关查验。
车辆使用合规：
- 儿子在使用车辆时，应遵守交通法规，确保车辆安全行驶。
- 若因儿子使用不当导致车辆损坏或发生交通事故，应由儿子承担相应的赔偿责任。
三、潜在风险及防范
关联交易风险：
- 若租赁价格明显偏离市场价，可能被视为关联交易，引发税务机关或监管机构的关注。
- 为防范此风险，建议双方在签订合同时，明确租金确定依据，并保留好相关市场调研资料。
家庭财产与企业财产混同风险：
- 若父亲独资企业未严格区分家庭财产与企业财产，可能导致企业财产被视为家庭共同财产，从而影响企业的独立法人地位。
- 为防范此风险，建议企业建立健全的财务管理制度，确保企业财产与家庭财产的严格分离。
合同履行风险：
- 若儿子在使用车辆过程中违反合同约定，如未按时支付租金、损坏车辆等，父亲独资企业有权依据合同约定追究其违约责任。
- 为降低此风险，建议双方在签订合同时，明确违约责任及争议解决方式。
总结与建议：儿子租用父亲独资企业的车在一般情况下是合法的，但需要满足合同内容合法、租金合理、税务合规以及车辆使用合规等条件。为防范潜在风险，建议双方在签订合同时明确各自的权利义务，并保留好相关凭证。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。