结论：书店擅自存放教材是否违法，需根据具体情况判断，主要涉及著作权侵权及不正当竞争两个法律层面。以下从这两个角度进行详细分析：
一、著作权侵权角度
教材著作权归属：
- 教材作为文字作品，其著作权通常归属于作者或出版社（若作者已将著作权转让给出版社）。未经著作权人许可，他人不得擅自复制、发行、出租、展览、表演、放映、广播、信息网络传播其作品。
书店存放教材的行为性质：
- 若书店存放的教材是正版且已合法购入，仅用于销售或展示，不涉及复制、发行等侵权行为，则通常不构成著作权侵权。
- 若书店存放的教材是盗版或未经著作权人许可复制的，即使书店未直接销售，也可能因“持有”侵权复制品而面临法律责任，尤其是在明知或应知是侵权复制品的情况下。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国著作权法》第五十三条，未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，应当根据情况，承担停止侵害、消除影响、赔礼道歉、赔偿损失等民事责任。
- 若书店的行为构成犯罪，如销售侵权复制品罪，还可能面临刑事处罚。
二、不正当竞争角度
不正当竞争的定义：
- 不正当竞争是指经营者违反《中华人民共和国反不正当竞争法》的规定，损害其他经营者或消费者的合法权益，扰乱社会经济秩序的行为。
书店存放教材与不正当竞争：
- 若书店通过擅自存放并销售盗版教材，以低于正版教材的价格吸引消费者，从而获取不正当利益，损害了正版教材出版商或销售商的合法权益，可能构成不正当竞争。
- 即使书店存放的是正版教材，但若通过不正当手段（如虚假宣传、恶意诋毁竞争对手等）获取市场份额，也可能构成不正当竞争。
法律后果：
- 根据《中华人民共和国反不正当竞争法》第十七条，经营者违反本法规定，给他人造成损害的，应当依法承担民事责任。
- 不正当竞争行为还可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
三、建议与总结
对书店的建议：
- 确保存放的教材均为正版且已合法购入，避免涉及著作权侵权。
- 遵守市场竞争规则，不进行不正当竞争行为，如虚假宣传、恶意诋毁竞争对手等。
对消费者的建议：
- 购买教材时选择正规书店或渠道，避免购买盗版教材。
- 如发现书店存在违法行为，可向相关部门举报或寻求法律帮助。
总结：书店擅自存放教材是否违法，需根据教材是否正版、是否获得著作权人许可、是否存在不正当竞争行为等因素综合判断。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。