土地确权时补办二轮土地承包合同，通常需要准备以下手续和材料，并按照相应流程进行办理：

1. 准备基础材料

   • 身份证明：申请人（户主或承包方代表）的身份证原件及复印件。
     
   • 户籍证明：户口簿原件及复印件，用于确认家庭成员关系及承包人口。
     
   • 原承包合同或权属证明：若存在第一轮或二轮承包合同、土地承包经营权证等，需提供原件或复印件作为补办依据。
     
   • 土地权属证明：如集体土地所有权证、村集体出具的权属证明等，证明土地归属。
     

2. 提交书面申请

   • 向村集体经济组织（村委会）提交书面补办申请，说明补办原因（如合同遗失、损毁等），并附上上述材料。
     
   • 若涉及土地调整或变更，需明确说明调整原因及依据（如人口变动、土地互换等）。
     

3. 村集体审核与公示

   • 村集体经济组织对申请材料进行审核，确认承包关系真实性及土地现状。
     
   • 审核通过后，需在村内公示补办信息（如承包方姓名、地块位置、面积等），公示期一般不少于7天，确保无异议。
     

4. 乡镇政府备案与审批

   • 公示无异议后，村集体将申请材料及公示结果报乡镇政府农村土地承包管理部门备案。
     
   • 乡镇政府审核通过后，出具补办批复或直接补发新的土地承包合同。
     

5. 领取新合同并登记

   • 申请人凭批复或通知到村集体或乡镇政府领取补办的二轮土地承包合同。
     
   • 部分地区可能要求同步更新土地承包经营权证，需按当地规定办理登记手续。
     

注意事项：

• 地区差异：具体流程和材料可能因地方政策而异（如部分省份要求提供土地测绘图），建议提前咨询当地农业农村局或乡镇政府。
  
• 时间限制：若因历史遗留问题补办，需说明情况并配合提供其他佐证材料（如证人证言、缴费凭证等）。
  
• 法律效力：补办的合同与原合同具有同等法律效力，需妥善保管。
  

特殊情况处理：

• 合同纠纷：若补办过程中出现争议（如地块权属不清），需先通过协商、调解或诉讼解决纠纷后再补办。
  
• 政策衔接：若涉及二轮承包到期延包（如部分地区试点30年不变政策），需按最新政策要求补办。
  

如有其他细节问题（如材料格式、公示方式等），可直接向我咨询，我会结合您所在地区的具体政策进一步解答。