结论：公务员入职时发现舅舅有案底，一般情况下不会对您的入职产生直接影响。但具体是否受影响，还需结合您报考的公务员岗位性质以及舅舅案底的具体情况来综合判断。

分析说明：

1. 公务员入职考察的主要内容：

   • 公务员入职时，主要考察的是报考者本人的政治素质、道德品质、能力素质、心理素质、学习和工作表现、遵纪守法、廉洁自律、职位匹配度以及是否需要回避等方面的情况。
   • 考察过程中，虽然会涉及对报考者家庭成员和主要社会关系的了解，但主要是为了了解报考者的成长环境、性格特点等，以评估其是否适合担任公务员职务，而非直接因其家庭成员的案底而否定其入职资格。

2. 舅舅案底对入职的潜在影响：

   • 一般情况：舅舅作为您的旁系亲属，其案底通常不会直接成为您入职公务员的障碍。公务员入职考察更侧重于报考者本人的表现和素质。
   • 特殊情况：如果您报考的公务员岗位涉及国家安全、机要等特殊领域，或者舅舅的案底与报考岗位有直接关联（如舅舅因危害国家安全罪被判刑，而您报考的岗位涉及国家安全工作），那么舅舅的案底可能会成为考察过程中的一个考量因素，但并非决定性因素。此时，考察机关会综合评估您本人的表现、素质以及舅舅案底的具体情况，来决定是否录用您。

3. 法律建议：

   • 如果您担心舅舅的案底会影响您的公务员入职，可以提前了解报考岗位的具体要求和考察标准，以便有针对性地准备。
   • 在入职考察过程中，如实向考察机关说明您与舅舅的关系以及舅舅案底的具体情况，避免隐瞒或虚假陈述导致的不良后果。
   • 如果因舅舅的案底而面临入职困难，您可以积极与考察机关沟通，提供相关证据证明您本人的表现和素质符合公务员入职要求，争取入职机会。

后续行动建议：

• 如果您对公务员入职考察的具体流程或标准有疑问，或者担心舅舅的案底会影响您的入职，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。
• 在准备公务员入职考察时，建议您提前整理好个人资料、工作经历、学习经历等相关材料，以便在考察过程中能够迅速、准确地提供所需信息。