如果当事人对分配方案有异议，但法院不采纳，可以按照以下步骤处理：

1. 仔细审查法院的裁定或判决
   首先，要认真阅读法院作出的裁定书或判决书，明确法院不采纳异议的具体理由。这是后续采取行动的基础，只有了解法院的裁判逻辑，才能针对性地提出下一步措施。

2. 考虑是否符合上诉条件
   如果认为法院的裁定或判决存在错误，且该裁定或判决属于可以上诉的范围（例如，一审判决或某些裁定），可以在法定期限内（通常是15天）向上一级法院提起上诉。在上诉时，需要提交上诉状，详细说明对分配方案的异议以及法院未采纳的理由，并提供相关证据支持自己的主张。

3. 申请再审
   如果已经错过了上诉期限，或者裁定/判决已经生效，但认为法院的裁判存在重大错误（例如，事实认定不清、法律适用错误等），可以向原审法院或上一级法院申请再审。再审申请需要提交书面材料，详细阐述再审理由，并提供新的证据或证明原裁判存在错误的证据。

4. 通过执行异议程序救济
   如果分配方案是在执行程序中作出的，且法院不采纳异议后已经进入执行阶段，可以向执行法院提出执行异议。执行异议需要提交书面申请，说明对分配方案的具体异议及理由。如果执行法院驳回异议，还可以在法定期限内向上一级法院申请复议。

5. 寻求其他法律途径
   如果上述途径均无法解决问题，还可以考虑通过其他法律途径维护自己的权益，例如，向检察机关申请法律监督（如果认为法院的裁判存在违法行为），或者通过协商、调解等方式与对方达成和解。

建议：在整个过程中，建议当事人保留好所有与分配方案相关的证据材料，包括但不限于合同、协议、付款凭证、沟通记录等。这些证据将在后续的上诉、再审或执行异议程序中发挥关键作用。如果对法律程序不熟悉，可以随时向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律指导。