关于货物买卖合同中质量问题超过90天能否退货的问题，结论需分情况讨论，具体分析如下：

1. 合同有明确约定时

若买卖合同中明确约定了质量异议期（如“买方应在收货后90日内提出质量问题，逾期视为验收合格”），且该条款不违反法律强制性规定（如《民法典》第496条关于格式条款的提示说明义务），则：

• 超过约定期限提出退货的，卖方有权拒绝。此时买方可能丧失合同约定的救济权利，但可尝试通过协商解决。
• 例外情形：若卖方故意隐瞒质量问题（如欺诈），或质量问题导致人身安全等重大损害，买方仍可依据《民法典》第148条（欺诈）或第180条（紧急避险）主张权利。

2. 合同未约定或约定不明时

根据《民法典》第621条：

• 买方在合理期限内未通知或自收到货物之日起2年内未通知的，视为质量符合约定。但若质量问题在交付时即存在且买方无法在2年内发现（如隐蔽瑕疵），可在发现后合理期限内主张权利。
• “合理期限”的认定：需结合货物性质、交易习惯等因素综合判断。例如，易腐货物可能仅需数日，而大型机械设备可能需数月甚至更长时间。若90天仍属合理期限内，买方有权要求退货、换货或修理。

3. 卖方提供质量保证期时

若卖方在合同或保修单中承诺了更长的质量保证期（如“整机保修1年”），则：

• 在保证期内发现质量问题的，买方有权要求卖方承担违约责任，包括退货、换货、修理或赔偿损失等。
• 保证期与法定期间的关系：若保证期短于法定2年期间，买方仍可在法定期间内主张权利；若长于法定期间，则以保证期为准。

4. 买方已实际使用货物的影响

若买方在发现质量问题后仍继续使用货物，可能导致：

• 卖方主张买方以行为表明接受货物质量，从而拒绝退货。但若使用行为与质量问题无直接关联（如机器故障但买方需临时使用完成订单），则不影响退货权。
• 买方需承担货物因继续使用导致的价值减损责任，卖方有权在退货时扣除相应金额。

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