电动自行车牌套牌协议是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律角度
违反交通管理法规：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，使用伪造、变造的机动车号牌、行驶证、驾驶证等是违法行为。电动自行车虽然不属于机动车范畴，但套牌行为同样扰乱了交通管理秩序，损害了合法车主的权益，因此也是不被允许的。
- 套牌行为可能导致交通管理部门无法准确追踪车辆信息，影响事故处理、违章处罚等工作的正常进行，从而危害公共安全。
合同无效性：
- 套牌协议本身是基于非法目的而订立的，根据《中华人民共和国民法典》的规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，电动自行车牌套牌协议自始无效，不具有法律约束力。
实际后果角度
法律责任：
- 如果被发现使用套牌电动自行车，车主可能面临罚款、扣车等行政处罚。同时，如果套牌行为涉及伪造、变造国家机关证件等犯罪行为，还可能承担刑事责任。
- 对于签订套牌协议的双方而言，由于协议无效，一旦发生纠纷或违法行为，双方都可能面临法律责任，无法依据协议来维护自己的权益。
损害他人权益：
- 套牌行为可能损害合法车主的权益，如导致合法车主被误认为违章或事故责任方，从而遭受不必要的损失和麻烦。
建议与风险提示
遵守法律法规：
- 作为电动自行车车主，应严格遵守交通管理法规，不使用套牌、假牌等违法行为。如果车辆号牌丢失或损坏，应及时到相关部门办理补办手续。
谨慎签订协议：
- 在签订任何与车辆相关的协议时，都应仔细审查协议内容，确保协议合法、有效且符合双方真实意愿。避免签订基于非法目的或违反法律法规的协议。
增强法律意识：
- 车主应增强法律意识，了解并遵守相关法律法规，避免因无知或疏忽而陷入法律纠纷。如果遇到法律问题或疑问，应及时咨询专业律师以获取准确、可靠的法律意见。
综上所述，电动自行车牌套牌协议是不合法的，不仅违反了交通管理法规，还可能导致严重的法律后果。因此，我建议你不要签订或参与任何形式的套牌协议，而是遵守法律法规，合法使用电动自行车。如果你有任何法律问题或疑问，可以直接向我咨询。