结论：申请财产保全期间，公司可以依法进行变更，但需根据变更类型（如股权转让、名称变更、法定代表人变更等）采取相应法律措施，否则可能影响保全效力或引发执行风险。 以下是具体分析：

1. 公司变更的合法性不受保全限制

财产保全的目的是限制被保全财产的处分（如转让、抵押等），但公司作为法人主体，其登记事项（如名称、法定代表人、股东、注册资本等）的变更属于工商行政管理范畴，只要符合《公司法》及《市场主体登记管理条例》的规定（如完成内部决策程序、办理工商变更登记等），即可依法变更。
例外情形：若保全措施直接针对公司股权（如冻结股东持有的股权），则该股权的转让、质押等处分行为会被限制，但公司其他登记事项（如名称、法定代表人）仍可变更。

2. 公司变更可能影响保全效力的情形

• 股权变更：若保全的是公司名下财产（如银行账户、房产），但公司通过股权转让变更实际控制人，新股东可能通过转移资产、增设债务等方式规避执行。此时，申请人可依据《民事诉讼法》第103条，向法院申请追加被执行人或撤销恶意转让行为。
  
• 名称/法定代表人变更：若公司仅变更名称或法定代表人，但实际控制人未变，保全效力不受影响；但若变更后公司拒不配合执行，法院可对现法定代表人采取罚款、拘留等措施（《民事诉讼法》第114条）。
  
• 分立/合并：若公司分立或合并，根据《公司法》第174条，保全效力自动及于分立/合并后的主体，但申请人需及时向法院申请变更被执行人。

3. 申请人的应对建议

• 提前防范：在申请保全时，可要求法院同时冻结公司股权、查封核心资产，或限制公司办理工商变更登记（需向工商部门送达协助执行通知书）。
  
• 动态监督：若发现公司变更，立即向法院提交《变更被执行人申请书》，并提供变更登记材料、资金流向等证据，证明变更存在恶意。
  
• 追加执行：若公司变更后无财产可供执行，可调查原股东是否未实缴出资、是否存在抽逃出资等情形，申请追加原股东为被执行人（《公司法司法解释三》第13-14条）。

总结：公司变更本身不违反法律，但若变更行为损害申请人利益，可通过法律程序追究相关主体责任。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据为您制定应对方案。