结论：违纪行为已结案后，是否会追缴未退还的款项，这主要取决于违纪行为的性质、相关法律法规的规定以及具体案件的处理情况。以下从不同角度进行分析：

1. 违纪行为性质与追缴关系：

   • 如果违纪行为涉及贪污、受贿、挪用公款等违法犯罪行为，且相关款项未退还，那么在案件结案后，根据法律规定，相关部门（如检察院、法院或纪检监察机关）有权继续追缴这些未退还的款项。这是因为这些款项属于违法所得，应当依法予以没收或追缴。
   • 如果违纪行为不构成犯罪，但违反了单位规章制度或行业规范，且涉及未退还的款项，单位或行业主管部门可能会根据内部规定或行业规范，要求违纪者退还相关款项。这种情况下，追缴的依据主要是内部规章制度或行业规范，而非法律法规。

2. 法律法规对追缴的规定：

   • 对于涉及违法犯罪的违纪行为，如贪污、受贿等，相关法律法规（如《刑法》、《刑事诉讼法》等）明确规定了违法所得的追缴程序。在案件结案后，如果违法所得未退还，相关部门将依法进行追缴。
   • 对于不构成犯罪的违纪行为，虽然法律法规可能未直接规定追缴程序，但单位或行业主管部门可以依据内部规章制度或行业规范进行追缴。这些规章制度或规范通常会在违纪者入职或加入行业时明确告知，并作为违纪处理的重要依据。

3. 具体案件处理情况：

   • 在实际案件中，是否追缴未退还的款项还取决于案件的具体处理情况。例如，如果违纪者在案件处理过程中已经主动退还了部分或全部款项，那么在案件结案后可能就不会再追缴。
   • 另外，如果违纪者确实存在经济困难，无法一次性退还全部款项，相关部门或单位可能会根据实际情况，与违纪者协商制定分期退还计划或其他解决方案。

法律建议：

• 如果您或您身边的人涉及违纪行为且未退还相关款项，建议尽快咨询专业律师或相关法律机构，了解具体的法律后果和追缴程序。
• 在处理违纪行为时，应积极配合相关部门或单位的调查和处理工作，主动退还违法所得或相关款项，以减轻法律后果和避免不必要的麻烦。

可能法律后果：

• 如果违纪行为涉及违法犯罪且未退还相关款项，可能会面临刑事处罚（如有期徒刑、罚金等）和民事赔偿（如退赔违法所得等）。
• 如果违纪行为不构成犯罪但违反了单位规章制度或行业规范且未退还相关款项，可能会面临单位内部的纪律处分（如警告、记过、开除等）或行业内的信用惩戒（如列入黑名单、限制从业等）。