结论前置：投标保证金不能随意扣除所有投标人的，其扣除需基于法定或约定的情形，且需严格遵循相关程序。关于具体违反行为的认定，需结合招标文件规定、投标人行为及法律法规进行综合判断。
1. 投标保证金扣除的法定与约定情形
法定情形：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，投标保证金主要在以下情形下可被扣除：
约定情形：招标文件通常会明确规定投标保证金的扣除条件，这些条件应合法、合理且明确。若投标人违反招标文件中的特定规定，如未按时参加开标会、提供虚假资料等，招标人也有权根据约定扣除投标保证金。
2. 具体违反行为的认定
审查招标文件：首先，需仔细审查招标文件，明确其中关于投标保证金扣除的具体条款和条件。这是认定投标人是否违反规定的基础。
分析投标人行为：其次，根据招标文件的规定，分析投标人的具体行为是否构成违约。例如，若招标文件规定投标人需按时参加开标会，而某投标人未按时参加，则该行为可能构成违约。
结合法律法规：在认定投标人行为是否构成违约时，还需结合相关法律法规进行判断。如投标人的行为是否违反了《中华人民共和国招标投标法》等法律法规的规定。
程序合法性：即使投标人存在违约行为，招标人在扣除投标保证金时也需遵循法定程序。如应事先通知投标人，给予其陈述和申辩的机会；扣除后应及时退还剩余保证金或说明扣除理由等。
3. 实际操作中的注意事项
明确条款：招标人在制定招标文件时，应明确投标保证金的扣除条件、程序及金额等，以避免后续争议。
及时沟通：在发现投标人可能存在违约行为时，招标人应及时与投标人沟通，了解其情况并给予合理的解释和申辩机会。
依法处理：在扣除投标保证金时，招标人应严格遵守相关法律法规和招标文件的规定，确保程序的合法性和公正性。
4. 法律后果
若招标人未经法定或约定程序擅自扣除投标保证金，可能面临被投标人起诉要求返还保证金及赔偿损失的风险。
若投标人确实存在违约行为，但招标人未按照法定或约定程序扣除保证金，也可能影响招标人的权益和招标活动的顺利进行。
建议：在实际操作中，招标人和投标人均应严格遵守相关法律法规和招标文件的规定，确保投标保证金的处理合法、合理且公正。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。