病假三天工资的扣除需根据具体情况判断，通常遵循以下原则：

1. 医疗期内的病假工资
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工在医疗期内享有病假工资，且不得低于当地最低工资标准的80%（具体比例可能因地区而异）。例如，若当地最低工资为2000元/月，则病假工资至少为1600元/月，按实际出勤天数折算后，三天病假工资通常不会被全额扣除，而是按比例发放。

2. 医疗期外的病假工资
   若员工医疗期已满但仍需请假，企业可依据内部规章制度或劳动合同约定处理。此时，企业可能不支付病假工资，或按更低标准发放（如事假工资）。但需注意，企业不得因此单方面解除劳动合同，除非员工无法从事原工作且无法调整岗位。

3. 地方性规定的差异
   部分地区对病假工资有更详细的规定。例如，《上海市企业工资支付办法》明确，医疗期内病假工资按员工工龄和工资比例发放（如连续工龄8年以上，病假工资为本人工资的100%）。因此，需结合当地政策判断。

建议行动：

• 查阅当地最低工资标准及病假工资相关规定；
  
• 核对劳动合同或企业规章制度中关于病假工资的条款；
  
• 若企业未按规定支付，可先与企业协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

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