核心结论：两个公司之间欠款12年，处理方式需结合诉讼时效、证据情况、双方协商意愿等多方面因素综合判断，以下是具体分析：

1. 诉讼时效问题

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，普通诉讼时效为三年，自权利人知道或应当知道权利受到损害之日起计算。若欠款发生在12年前，且期间未中断或中止诉讼时效（如对方明确承认债务、签署还款协议等），则可能已超过诉讼时效，债权人可能丧失胜诉权。

• 例外情形：若债务人明确表示愿意履行债务（如书面承诺还款、部分还款等），或债权人能证明曾多次催讨（如录音、书面催款函、证人证言等），可能构成诉讼时效中断，时效重新计算。
  
• 建议：立即梳理所有与债务相关的证据（如合同、对账单、催款记录等），确认诉讼时效是否中断或中止。若时效已届满，仍可尝试通过协商或非诉讼方式解决。

2. 证据收集与固定

即使诉讼时效可能存在问题，证据的充分性仍是关键。需重点收集以下材料：

• 基础债权证据：如借款合同、购销合同、对账单、发票等，证明双方存在债权债务关系；
  
• 履行情况证据：如送货单、验收单、付款记录等，证明债务人未完全履行义务；
  
• 催款证据：如律师函、催款短信、邮件、录音等，证明债权人曾主张权利（可能影响诉讼时效）；
  
• 债务人财产线索：如银行账户、房产、车辆等，为后续执行提供保障。
  
• 建议：若证据不足，可尝试通过补充协议、对账函等方式固定债务，或通过公证、见证等方式增强证据效力。

3. 协商与调解

若诉讼时效存在风险或证据不够充分，优先通过协商或调解解决，可降低时间成本和诉讼风险：

• 协商还款：与债务人沟通，制定分期还款计划或以物抵债方案；
  
• 第三方调解：通过商会、行业协会或人民调解委员会等机构介入，促成和解；
  
• 签署还款协议：若达成一致，务必签订书面协议并明确还款期限、违约责任等，避免口头约定。
  
• 建议：协商过程中可同步固定证据（如录音、书面确认函），为后续可能的诉讼做准备。

4. 诉讼或仲裁

若协商无果且证据充分，可考虑通过法律途径解决：

• 诉讼：向法院提起民事诉讼，要求债务人偿还欠款及利息（若合同有约定）；
  
• 仲裁：若合同中有仲裁条款，可向约定的仲裁机构申请仲裁；
  
• 执行：胜诉后若债务人拒不履行，可申请法院强制执行其财产。
  
• 注意：若诉讼时效已届满，需在起诉时主动提出抗辩或通过其他方式（如债务人自愿履行）规避时效风险。

5. 其他注意事项

• 债务人主体资格：确认债务人公司是否仍存续、是否被吊销或注销，避免因主体问题导致执行困难；
  
• 财产保全：诉讼前或诉讼中可申请财产保全，防止债务人转移资产；
  
• 刑事报案：若债务人涉嫌诈骗或拒不执行判决、裁定罪，可向公安机关报案。

总结：12年的欠款需优先核查诉讼时效和证据情况，若时效未届满或存在中断情形，可立即起诉；若时效已届满，需通过协商、补充证据或非诉讼方式解决。建议尽快委托律师介入，全面评估风险并制定方案。如有进一步问题，可直接向我咨询。