结论：在贪污案件中，即使贪污的账款在被抓前已经还给单位，检察院仍有可能扣押涉案款项，但具体是否扣押需结合案件具体情况和法律规定来判断。

分析说明：

1. 贪污款项的性质与扣押依据：

   • 贪污款项属于违法所得，根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔。这意味着，无论贪污款项是否已被归还，其违法性质不变，检察院在侦查过程中有权对涉案款项进行扣押，以确保案件的顺利办理和违法所得的追缴。

2. 已归还款项的考量：

   • 如果贪污款项在侦查机关介入前已被归还单位，这可以作为犯罪嫌疑人悔罪表现的一个情节，在量刑时予以考虑。然而，这并不改变贪污款项的违法性质，也不影响检察院对涉案款项的扣押权。检察院仍需对款项的来源、去向以及是否涉及其他违法犯罪行为进行调查，因此扣押款项是必要的侦查措施。

3. 扣押款项的后续处理：

   • 在案件侦查终结后，如果确认贪污款项已全部归还且没有其他违法犯罪行为，检察院可能会根据具体情况决定是否解除扣押。如果款项确实属于违法所得，且未全部归还或存在其他违法犯罪行为，检察院将依法追缴或责令退赔，并将款项上缴国库。

4. 特殊情况的处理：

   • 如果贪污款项的归还涉及复杂的财务操作或存在其他争议，检察院可能会要求单位提供相关证据以证明款项的合法性和归还情况。在这种情况下，扣押款项的期限可能会延长，直至争议得到解决。

法律建议：

• 对于犯罪嫌疑人：如果贪污款项已归还单位，应主动向检察院说明情况，并提供相关证据以证明款项的合法性和归还情况。这有助于争取从轻或减轻处罚的机会。
• 对于单位：如果收到犯罪嫌疑人归还的贪污款项，应妥善保管相关证据，并积极配合检察院的调查工作。在必要时，可以寻求法律专业人士的帮助以确保自身权益不受损害。

可能后果：

• 如果检察院认为扣押款项是必要的侦查措施，且犯罪嫌疑人或单位无法提供充分证据证明款项的合法性和归还情况，那么款项可能会被继续扣押直至案件终结。
• 如果案件最终认定贪污款项已全部归还且没有其他违法犯罪行为，检察院将依法解除扣押并返还剩余款项（如果有的话）。

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