在交通事故中，如果机动车与电动自行车被认定为同等责任，那么赔偿问题需要依据相关法律法规及事故具体情况来综合确定。以下是对这一问题的详细解析：
一、赔偿原则
在同等责任的情况下，双方通常需要各自承担50%的赔偿责任。这意味着，对于事故造成的损失，无论是人身损害还是财产损失，双方都需要按照这一比例进行分担。这一原则基于《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，旨在确保事故双方公平地承担责任。
二、赔偿范围与计算方式
人身损害赔偿：
- 包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费以及必要的营养费等。
- 若因伤致残，还需考虑残疾赔偿金、残疾辅助器具费、被扶养人生活费，以及因康复护理、继续治疗实际发生的必要康复费、护理费、后续治疗费等。
- 计算时，需根据实际发生的费用凭证进行核算，并按照50%的责任比例分担。
财产损失赔偿：
- 包括车辆维修费、车载物品损失、施救费用等直接经济损失。
- 赔偿金额以实际修复或重置成本为准，扣除残值后按50%的责任比例分摊。
三、赔偿流程
确定损失：
- 双方应全面评估事故造成的人身损害和财产损失情况，确保所有损失项目都被准确记录。
交强险赔付：
- 机动车方应首先通过交强险进行赔付。交强险有责赔偿限额通常为医疗费用18000元，死亡伤残180000元，财产损失2000元。
- 电动自行车方如果购买了相关保险（如意外险），也可以按照保险合同约定进行理赔。
超出部分分担：
- 对于超出交强险赔付限额的部分，双方按照50%的比例进行分担。
协商处理：
- 双方可先行协商赔偿事宜，达成一致后签订书面协议，明确赔偿金额、支付方式及期限。
诉讼解决：
- 若协商未果，可向事故发生地或被告住所地人民法院提起诉讼，由法院根据具体情况进行裁决。
四、特殊情形处理
电动车属性争议：
- 如果电动自行车被鉴定为机动车，可能改变责任划分比例。例如，超标电动自行车可能因未投保交强险而需自行承担更多赔偿责任。
保险不足或拒赔：
- 当保险额度不足以覆盖损失时，超出部分需由责任人自行承担。
- 如果保险公司拒赔，可通过法律途径主张权利。
五、注意事项
证据收集：
- 双方应妥善保留相关证据，如事故现场照片、监控录像、医疗诊断证明、费用清单、车辆维修发票等，以便后续协商或诉讼时使用。
时效要求：
- 人身损害赔偿诉讼时效为三年，财产损失诉讼时效为两年。逾期起诉可能丧失胜诉权，因此应及时处理赔偿事宜。
综上所述，当机动车与电动自行车发生交通事故且双方承担同等责任时，赔偿问题应依据相关法律法规和赔偿原则进行妥善处理。双方应积极沟通协商，并妥善保留相关证据，以便在必要时通过法律途径维护自身权益。