违法建筑主要由城乡规划主管部门或城市管理综合行政执法部门进行确认。以下是对此问题的详细分析：

1. 城乡规划主管部门的角色：

   • 根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，城乡规划主管部门负责城乡规划的制定、实施和监督管理工作。在违法建筑的认定上，城乡规划主管部门具有专业的规划知识和判断能力，能够依据城乡规划对建筑物的合法性进行评估。
   • 当建筑物违反城乡规划，如未取得建设工程规划许可证或未按照建设工程规划许可证的规定进行建设时，城乡规划主管部门有权进行认定，并出具相应的认定意见。

2. 城市管理综合行政执法部门的角色：

   • 在一些地区，城市管理综合行政执法部门（也称为城管部门）也承担着违法建筑的查处工作。这些部门通常具有行政执法权，能够对违法建筑进行调查、取证和认定。
   • 城市管理综合行政执法部门在认定违法建筑时，会依据相关法律法规和城乡规划，结合现场勘查、调查询问等方式，对建筑物的合法性进行综合判断。

在实际操作中，违法建筑的确认可能涉及多个部门的协作：

• 例如，在发现疑似违法建筑时，可能首先由城市管理综合行政执法部门进行初步调查，并将相关情况报告给城乡规划主管部门。
• 城乡规划主管部门在收到报告后，会进一步进行核实和认定，并出具正式的认定意见。
• 在某些情况下，如果违法建筑涉及多个方面或存在争议，可能还需要其他相关部门（如国土资源部门、建设部门等）的参与和协助。

对于违法建筑的确认，应当遵循严格的法律程序和规定：

• 相关部门在确认违法建筑时，必须依法进行调查、取证和认定，确保认定结果的合法性和准确性。
• 如果建筑物被确认为违法建筑，相关部门将依法采取相应的处理措施，如责令限期拆除、罚款等。

建议：

• 如果您对某建筑物的合法性存在疑问，或者认为某建筑物可能属于违法建筑，可以向当地的城乡规划主管部门或城市管理综合行政执法部门进行咨询和举报。
• 在处理违法建筑问题时，请务必遵守相关法律法规和规定，避免采取过激或违法的行为。

如有任何进一步的问题或需要法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。