协议拆迁在多数情况下仍需履行房屋征收的法定申请程序，但具体是否需要申请取决于拆迁项目的性质和地方性法规要求。以下分情况详细说明：

1. 国有土地上房屋征收（需申请）
   根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第八条，政府因公共利益（如旧城改造、基础设施建设）需征收房屋的，必须由市、县级人民政府作出房屋征收决定，并履行申请、公告、听证等法定程序。即使拆迁方与被拆迁人通过协商达成补偿协议（即“协议拆迁”），征收决定的申请仍是前置条件，否则拆迁行为可能因缺乏合法依据被认定为违法。

2. 集体土地上房屋拆迁（分情况）

   • 征收转用情形：若涉及农用地转用或集体土地征收为国有，需依据《土地管理法》第四十四条、第四十六条，由县级以上人民政府向省级政府或国务院申请批准，并发布征收土地公告。协议拆迁需在此框架内进行。
     
   • 协议搬迁情形：部分地区试点“协议搬迁”（如城中村改造中村民自愿腾退土地），若不涉及土地性质变更，可能无需严格履行征收申请程序，但需符合地方性法规（如《北京市集体土地房屋拆迁管理办法》）。此类情形需以地方政策为准，且需确保村民自愿、补偿公平。

3. 特殊情形：协议拆迁的合法性边界

   • 若拆迁方未取得合法征收手续，仅以“协议拆迁”名义与被拆迁人签订补偿协议，可能涉嫌规避法定程序，被拆迁人有权拒绝并要求依法征收。
     
   • 即使签订协议，若补偿标准低于法定标准（如《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十九条规定的“市场评估价”），被拆迁人仍可通过行政复议或诉讼主张权益。

建议：

• 若您面临协议拆迁，务必要求拆迁方出示征收决定、规划许可等法定文件，核实项目合法性。
  
• 对补偿协议条款（如补偿方式、金额、搬迁期限）需仔细审查，必要时委托律师协助谈判或审查合同。
  
• 如遇强制拆迁或补偿不合理，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身权益。
  

如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合地方政策为您详细分析。